Каталог
Вернуться к результатам поиска
SNP TOOLBOX - геномные вариации
Вернуться к результатам поиска
SNP TOOLBOX - геномные вариации
Наш инструмент помогает:
быстро получать исчерпывающую информацию по каждой вариации (гены, риски, болезни)
выбирать интересующие вариации, с помощью программных фильтров (по болезням, по положению в генах/хромосомах, по повреждающему эффекту, по встречаемости, а также неизвестные)
детально визуализировать интересующие вариации
Вариации можно загружать в любом доступном формате (vcg, gvf, …) полученные в любом исследовании, будь то секвенирование, PCR диагностика или микрочиповый анализ. Каждая загруженная вариация сравнивается с объединенной базой данных, собранной из курируемых открытых мировых источников (UCSC, OMIM, GAD,…) , и сводная информация выдается единым блоком. Можно отбирать из загруженных вариаций разные списки, удовлетворяющие критериям поиска. Отчет можно распечатать как по списку вариаций, так и по каждой в отдельности.
быстро получать исчерпывающую информацию по каждой вариации (гены, риски, болезни)
выбирать интересующие вариации, с помощью программных фильтров (по болезням, по положению в генах/хромосомах, по повреждающему эффекту, по встречаемости, а также неизвестные)
детально визуализировать интересующие вариации
Вариации можно загружать в любом доступном формате (vcg, gvf, …) полученные в любом исследовании, будь то секвенирование, PCR диагностика или микрочиповый анализ. Каждая загруженная вариация сравнивается с объединенной базой данных, собранной из курируемых открытых мировых источников (UCSC, OMIM, GAD,…) , и сводная информация выдается единым блоком. Можно отбирать из загруженных вариаций разные списки, удовлетворяющие критериям поиска. Отчет можно распечатать как по списку вариаций, так и по каждой в отдельности.
UGENE - открытая платформа биоинформатики
Unipro UGENE предоставляет множество методов обработки генетических и белковых последовательностей. Это — анализ, аннотирование, сравнение, поиск, выравнивание, моделирование, комплексные вычисления. Разнообразная визуализация, навигация и масштабирование, поддержка множества генетических форматов данных , оптимизация алгоритмов, возможности редактирования и графического построения различных вычислительных схем существенно ускоряют работу. UGENE отлично работает на Windows, Mac OS, Linux и прост в установке и использовании. Обладает интерфейсом как на русском, так и на английском языке.
Редактирование и аннотирование последовательностей
Поиск функциональных элементов и гомологов
Выравнивание и филогения
Клонирование in silico/ПЦР in silico
Работа с хроматограммами
Обработка данных NGS — сборка и визуализация генома, транскриптома, ChiP-Seq
Поиск геномных вариаций
Поиск в удаленных базах данных
Дизайнер вычислительных схем для многошагового анализа с десятками готовых схем
Произведено в: Новосибирск
Protomenal
Сервис позволяет сканировать последовательность с максимальной длиной 40 000 аминокислот на наличие совпадений с базами данных сигнатур белков.
Novel Software Systems
Новосибирск
Произведено в: Новосибирск
GENOMENAL
Загрузка и обработка данных
Автоматическое распознавание платформ секвенирования и типов данных
Поддержка различных форматов входных файлов: FASTQ, BAM, VCF
Обработка данных происходит в автоматическом режиме и не требует вмешательства
Все недочеты в данных будут выявлены на этапе обработки и продемонстрированы пользователю
Variant Viewer — инструмент для просмотра генетических вариантов
Удобный и интуитивно понятный интерфейс
Гибкость функционала за счет системы продвинутых фильтров
Обработка миллионов генетических вариантов
Аннотация
ClinVar, Ensembl, 1KG, dbNSFP, dbSNP, gnomAD v3, VarSome и другие открытые базы
Интеграция с IGV, PubMed, HPO, Google Scholar
Автоматический поиск по научным публикациям и актуальным рекомендациям профессионального сообщества по различным нозологиям
Возможность использовать собственную базу генетических находок
Novel Software Systems
Новосибирск
Произведено в: Новосибирск