Биореактивы

TAMRA (тетраметилродамин) — ксантеновый краситель с максимум флуоресценции при 567 нм. Данный продукт представляет собой чистый 6-изомер N-гидроксисукцинимидного эфира красителя TAMRA. Активированный эфир TAMRA легко реагирует с различными аминами и используется для получения флуоресцентно-меченых белков, пептидов, антител и других биомолекул.

Пирен - флуоресцентный углеводород, обладающий флуоресценцией в синей области. Это - малеимидопроизводное пирена для конъюгации с тиолами. Два остатка пирена, сближенные в пространстве, образуют флуоресцентные эксимеры. Благодаря этому, можно использовать его для изучения межмолекулярных взаимодействий и связывания биомолекул.

Краситель Cyanine3 в виде свободной карбоновой кислоты. Несульфированный краситель, обладающий хорошей растворимостью в органических растворителях и ограниченной растворимостью в воде. Может быть использован как нереакционноспособный флуорофор для калибровки и контрольных экспериментов. Может быть активирован карбодиимидами для этерификации по Штеглиху. Для мечения аминов рекомендуем активированный эфир Cyanine3 или водорастворимый активированный эфир sulfo-Cyanine3.

(E/Z)-4-Гидрокситамоксифен (4-OHT, цис/транс-4-гидрокситамоксифен, афимоксифен) — селективный модулятор эстрогеновых рецепторов (ER), активный метаболит тамоксифена. 4-Гидрокситамоксифен широко используется в исследованиях в качестве инструмента для индуцируемых манипуляций с геномом. 4-Гидрокситамоксифен используется в индуцируемой системе Cre-LoxP для контроля активности рекомбиназ CreER/CreERT2 и запуска тканеспецифической экспрессии генов или геномных/генетических модификаций (например, делеции генов). 4-Гидрокситамоксифен входит в состав систем TRAP/TRAP2, обеспечивающих генетический доступ к активности нейронов. Он также используется при редактировании генов CRISPR/Cas9 для активации инактивированной нуклеазы Cas9. Кроме того, 4-гидрокситамоксифен является внутримембранным ингибитором перекисного окисления липидов, способствующим удалению пероксильных радикалов.

dsGreen - очень чувствительный и специфичный краситель для детекции двухцепочечной ДНК. Благодаря этому его можно использовать в качестве универсального реагента для флуоресцентной детекции амплификации в ПЦР реального времени. Для этого не требуется использовать флуоресцентно меченые зонды - достаточно праймеров из природных нуклеотидов. Эта форма dsGreen специально создана для ПЦР режима реального времени. Ее отличия состоят в следующем: Концентрация красителя постоянна от партии к партии, поэтому результаты воспроизводимы Каждая партия красителя протестирована в ПЦР Низкая интенсивность фоновой флуоресценции, хорошее разгорание.

AF 343 (Кумарин), флуоресцирующий в синей области, используется как лазерный краситель. Данный флуорофор может также использоваться как FRET-донор для красителя FAM (флуоресцеин). AF 343 (Кумарин) X карбоновая кислота имеет функциональную COOH-группу, которую можно активировать для присоединения к аминогруппам белков.

Набор предназначен для высокоэффективного и быстрого выделения геномной ДНК из цельной крови и соскобов эпителия с использованием магнитных частиц. Данный набор призван обеспечить высокую производительность при выделении ДНК из большого количества образцов. Он совместим как с автоматическими рабочими станциями для выделения нуклеиновых кислот, так и с ручным выделением с использованием магнитного штатива. Выделение геномной ДНК проходит в два этапа. На первом этапе осуществляется подготовка образца: в него добавляют смесь магнитных частиц и протеиназы К, затем лизирующий раствор. На втором этапе производится промывка и последующая элюция геномной ДНК, сорбированной на магнитных частицах, с использованием автоматической станции или магнитного штатива. Выделенная геномная ДНК не содержит белков и других примесей. Процедура очистки ДНК на магнитных частицах с использованием автоматических станций позволяет обрабатывать большое количество образцов параллельно, что обеспечивает удобство и сокращает время работы с образцами, а также повышает воспроизводимость и надежность получаемых результатов.

Смесь ProbeMaster®️ UDG подходит как для проведения количественной ПЦР, так и для амплификации ДНК с последующей детекцией результатов методом электрофореза. Объем смеси 500 мкл рассчитан на проведение 100 реакций объемом 25 мкл. Готовая 5-кратная реакционная смесь содержит необходимые компоненты для проведения ПЦР, ее состав оптимизирован для получения идеальных результатов по процессивности и специфичности амплификации (содержит Hot-start полимеразу), а урацил-ДНК-гликозилаза исключает контаминацию ампликонами от предыдущих реакций и получение ложноположительных результатов. В случае постановки реакции кПЦР, для детекции флуоресценции следует использовать ДНК-зонд, меченный флуорофором и тушителем (гидролизуемые зонды, «молекулярные маяки», праймеры типа «скорпион») или два зонда, меченных флуорофорами, образующими FRET-пару (вы можете заказать синтез зондов в Lumiprobe). Помимо ДНК-зондов, для детекции флуоресценции может использоваться интеркалирующий краситель dsGreen. Состав реакционной смеси: HS Taq ДНК-полимераза, смесь дезоксинуклеозидтрифосфатов (включая dUTP), урацил-ДНК-гликозилаза (UDG), ПЦР-буфер (содержит Mg2+ с концентрацией 3 мМ в 1х реакционной смеси) Совместимость с оборудованием: совместим с амплификаторами любого типа Возможные приложения: качественная и количественная ПЦР с детекцией продуктов амплификации как в режиме реального времени, так и с помощью гель-электрофореза, ПЦР после обратной транскрипции

Дибензоциклооктин (ДБЦО, DBCO, ADIBO) — один из самых реакционноспособных циклоалкинов для реакций безмедной клик-химии (т.н. SPAAC, стерически промотируемого алкин-азидного циклоприсоединения). Скорость взаимодействия ДБЦО с азидами значительно выше, чем у других циклооктинов, а также Cu-катализируемой клик-реакции (CuAAC). В отличие от других циклооктинов, DBCO не вступает во взаимодействие с тетразинами, что позволят использовать его в биоортогональных реакциях совместно с транс-циклооктенами и тетразинами. Cyanine3B — цианиновый краситель с желтой эмиссией, являющийся улучшенной версией флуорофора Cyanine3 с высокой фотостабильностью. За счет зафиксированной конформации Cyanine3B имеет самый высокий квантовый выход эмиссии в сравнении с другими красителями этой длины волны. Данный краситель — сульфированное производное, которое можно использовать для конъюгации в водных растворах.

R6G (родамин 6G) - ксантеновый краситель, обладающий эмиссией в желтой области. Ранее он использовался для секвенирования; сейчас он находит широкое применение в ПЦР реального времени. Это чистый 5-изомер R6G, содержащий в структуре азидогруппу.

Модифицирующий носитель с размером пор 500 Å предназначен для синтеза олигонуклеотидов длиной до 50 оснований, модифицированных нефлуоресцирующим тушителем DusQ 1 на 3’-конце. Тушитель флуоресценции DusQ 1 характеризуется наиболее эффективным поглощением в диапазоне 480-580 нм, максимум поглощения находится при 534 нм. Подходит для смешанного тушения (сочетание статического и динамического тушения) большого числа флуорофоров, включая Biosearch Blue™, Marina Blue™, Edans, Bothell Blue, FAM™, JOE™, VIC™, R6G, HEX™, TET™, CAL Fluor™ Gold 540, Yakima Yellow™. Может использоваться для создания гибридизационных зондов типа TaqMan, Molecular Beacon, Scorpion.

Бициклононин (БЦН, BCN) - стабильный циклоалкин с высокой реакционной способностью в реакциях безмедной клик-химии (strain-promoted azyde-alkyne cycloaddition, SPAAC). В отличии от дибензоциклооктина (ДБЦО, DBCO), БЦН реактивен не только в отношении азидов, но и вступает в реакции циклоприсоединения Дильса-Альдера (IEDDA) с тетразинами. Бициклононин в эндо-BCN CE-фосфорамидит представлен в эндо-конформации, что обеспечивает более высокую скорость при циклоприсоединении по сравнению с экзо-конформером. БЦН-содержащие олигонуклеотиды могут быть использованы для конъюгации с азид- и тетразин-фунционализированными поверхностями, полимерами и большими белковыми молекулами. Время конденсации стандартное, как для амидитов природных нуклеозидов. На последнем шаге после конденсации амидита и окисления необходимо исключить стадию удаления диметокситритила (ДМТ, DMT), использовать протокол Dmt-ON. Условия деблокирования стандартные, с использованием концентрированного аммиака или смеси AMA (водный аммиак / 40% метиламин, 1:1).