Поиск

Гидразиды красителей подходят для мечения карбонильных соединений - альдегидов и кетонов. Многие сахара можно превратить в карбонильные соединения путем окисления периодатом. Тетраметилродамин (TAMRA) - ксантеновый краситель родаминового ряда. Это производное - чистый 5-изомер TAMRA, содержащий гидразидную группу для конъюгации с карбонильными соединениями.

Cyanine5.5 — флуорофор, испускающий свет в дальней красной области спектра, который широко используется для мультиплексной количественной ПЦР. Коммерческие шестиканальные приборы для ПЦР в реальном времени часто имеют канал для Cyanine5.5. Этот фосфорамидит можно использовать для синтеза 5’-меченых олигонуклеотидов путем прямого мечения в олигонуклеотидном синтезаторе. Структура функциональной группы фосфорамидита, которая присоединена к вторичному атому углерода, обеспечивает дополнительную устойчивость к перегруппировке Арбузова. Это помогает проводить синтез в течение более длительного времени по сравнению с фосфорамидитами, полученными из первичных спиртов.

ТЦО(тетразин-трансциклооктеновое) лигирование это одна из самых быстрых реакций, используемых в биоконъюгации. Это реакция Дильса-Альдера с обращенными электронными требованиями, которая протекает между тетразином и транс-циклооктеном или другими напряженными олефинами. sulfo-Cyanine5 тетразин - это производное флуорофора sulfo-Cyanine5 (аналог Sulfo-Cy5) с тетразиновой группой для мечения, основанного на ТЦО-лигировании. Реактив отличается хорошей растворимостью в воде и стабильностью в биологическом окружении.

BDP 581/591 - яркий, относительно гидрофобный универсальный флуорофор. Он обладает значительным сечением двухфотонного поглощения и относительно длительным временем жизни возбужденного состояния. Этот флуорофор реагирует с активными формами кислорода с изменением флуоресценции. Он может быть использован для мониторинга активных форм кислорода внутри клеток. Это азидное производное которое можно конъюгировать с малыми молекулами и биомолекулами для создания трейсеров для флуоресцентного поляризационного анализа и микроскопии.

Биотин-11-UTP является субстратом для РНК-полимераз SP6, T3 и T7. Биотинилированный трифосфат является аналогом природного UTP и используется для мечения РНК в реакции транскрипции in vitro. Биотинилированная РНК может использоваться вместо радиоактивно-меченой РНК во многих приложениях, включая Нозерн- и Саузерн-блоты, гибридизацию in situ и анализ на микрочипах. Последующая детекция биотинилированной РНК проводится с помощью различных методов с использованием конъюгатов стрептавидина, при этом длинный линкер из 11-ти атомов способствует эффективному взаимодействию биотина со стрептавидином.

Набор ProteOrange на основе флуоресцентного красителя позволяет измерять концентрацию белка с большей чувствительностью по сравнению со спектрофотометрическим и другими классическими методами количественного анализа белков (Lowry, Bradford, BCA). Краситель ProteOrange, главный компонент данного набора, в свободном виде не обладает выраженной флуоресценцией. В растворе краситель формирует комплексы с молекулами белка, при образовании которых он начинает флуоресцировать. Максимум возбуждения красителя ProteOrange в комплексе с белком находится при ~485 нм, максимум испускания флуоресценции при ~590 нм. Набор можно использовать на любом типе флуориметра с соответствующим источником возбуждения и каналом детекции. В общем случае, рабочий диапазон измеряемых концентраций белка ограничивается чувствительностью прибора. При использовании кюветного флуориметра рекомендуемый измеряемый диапазон концентрации белка от 10 нг/мл до 10 мкг/мл, для планшетного флуориметра — от 100 нг/мл до 10 мкг/мл. В состав набора входит флуоресцентный краситель ProteOrange, буфер для приготовления рабочего раствора красителя и стандарт концентрации белка (БСА, 2 мг/мл). Для измерения концентрации исследуемого белка необходимо приготовить рабочий раствор красителя и развести в нем экспериментальные образцы и образцы с известной концентрацией белка для построения калибровочной кривой. Для приготовления стандартов концентрации белка используется или бычий сывороточный альбумин, входящий в состав набора, или (при наличии) белок, который находится в экспериментальных образцах. Готовые образцы инкубируют 10 минут при 95 °С для денатурации белков, и после остывания до комнатной температуры проводится измерение интенсивности флуоресценции. В зависимости от объема образца количество измерений варьирует от 200 (для объем образца 2,5 мл и объема для измерения 2 мл для стандартной флуориметрической кюветы) до 2000 (для объема образца 250 мкл и объема для измерения 200 мкл для 96-луночного планшета).

Данное соединение является гидразидным производным красителя AF 488. Гидразиды эффективно взаимодействуют с альдегидами и кетонами с образованием гидразонов, поэтому данное соединение хорошо подходит для коньюгации с карбонильными производными биомолекул. Реакция проходит в водных условиях, что важно при работе с антителами и многими другими белками. Цис-диольные группы в сахарах в структуре гликозилированных белков и антител можно окислить в диальдегиды, а цистеин в белках можно ферментативно превратить в формилглицин — реакционноспособные группы для конъюгации с гидразидами. Карбоксильные группы аспарагиновой и глутаминовой кислот в белках и пептидах также могут быть конъюгированы с гидразидами в присутствии активирующих агентов: производных карбодиимида (EDAC) или метилморфолина (DMTMM). AF 488 — яркий и фотостабильный краситель. Благодаря своей гидрофильности, он хорошо подходит для мечения чувствительных белков и антител. Он предназначен для различных применений, включая микроскопию. AF 488 представляет собой сульфированный родаминовый краситель — родамин 110 (R110). Как и другие родамины, AF 488 представлен двумя изомерами, 5- и 6-. Они обладают практически идентичными фотофизическими свойствами. Изомеры требуют разделения, использование смеси изомеров может вести к «двоению» пиков меченых продуктов при ВЭЖХ и электрофоретическом разделении. Данный продукт содержит изомерно чистый 5-AF 488.

Модифицирующий носитель фосфат на основе стекла контролируемой пористости для синтеза 3'-фосфорилированных олигонуклеотидов. Фосфорилированные олигонуклеотиды используются для сборки генов путем лигирования. Фосфатная группа может блокировать 3'-5'-экзонуклеазную активность некоторых полимераз. Фосфатный модифицирующий носитель содержит специальную функциональную группу, оставляющую фосфат на олигонуклеотиде после аммонолиза. Этот реагент не требует внесения изменений в протокол олигонуклеотидного синтеза или деблокирования.

BDP TR - бордипиррометеновый краситель с длинами волн поглощения и эмиссии, близкими к ROX. BDP TR - яркий, умеренно гидрофобный флуорофор, обладающий небольшой молекулярной массой и длинами волн поглощения и эмиссии, близкими к ROX. Дополнительный линкер на основе аминокапроновой кислоты (C6) увеличивает расстояние между флуорофором и биомолекулой и снижает тушение. Активированные эфиры используются для конъюгации с аминогруппами белков, пептидов и других биомолекул.

Готовый набор для мечения антител красителем AF 594, эквивалентом Alexa Fluor® 594. Этот набор содержит все необходимые компоненты (реагенты и расходные материалы) для того, чтобы провести 10 реакций мечения (до 100 мкг антитела на реакцию). Очистка продукта осуществляется с помощью гель-фильтрации на спин-колонках, включенных в набор. Точное измерение количества красителя гарантирует воспроизводимый результат мечения и оптимальное число молекул красителя на молекулу антитела. Очищенные меченые антитела в буфере PBS будут готовы через 40 минут (из них только 10 минут работы руками). Набор совместим с Трис-буфером, азидом натрия, глицерином.

BAPTA AM представляет собой проникающую через клеточную мембрану форму высокоселективного хелатора кальция BAPTA. После загрузки в клетку BAPTA AM превращается в BAPTA под действием цитоплазматических эстераз. Этот хелатор широко используется для контроля концентрации кальция в цитозоле (Kd = 0,11 мкМ), ингибирования потенциалзависимых калиевых (Kv) каналов и в других задачах, оценивающих роль внутриклеточного кальция в передаче сигналов в клетках. BAPTA AM также может использоваться в качестве флуоресцентного индикатора кальция, поскольку его максимум поглощения изменяется после образования им комплекса с кальцием (максимум поглощения свободного/комплекса — 254/274 нм, максимум эмиссии свободного/комплекса — 363/363 нм). BAPTA AM чаще всего используют в диапазоне концентраций 10–100 мкМ. Поскольку ацетоксиметильные эфиры имеют низкую растворимость в воде, для облегчения загрузки вещества в клетку необходимо использовать мягкий детергент (например, Pluronic® F-127).

Бифункциональный реагент на основе ПЭГ3 с тиольной (SH-) и спиртовой (OH-) группами. Тиолы нуклеофильны и вступают в реакции с широким спектром электрофилов. Тиолы быстро реагируют с золотыми поверхностями и наночастицами с образованием самособирающихся монослоев. Тиольные реагенты можно использовать для гидрофильного покрытия золотых поверхностей.