Поиск

Реагент Lumizol представляет собой раствор, содержащий фенол, изотиоционат гуанидина и другие компоненты, позволяющие получить высококачественную РНК. Фенол и изотиоционат гуанидина обеспечивают лизис клеток и эффективно ингибируют рибонуклеазы, тем самым сохраняя РНК интактной. После гомогенизации и добавления хлороформа образец разделится на верхнюю водную фазу, интерфазу и нижнюю органическую фазу. РНК может быть преципитирована из верхней фазы с помощью изопропанола, в то же время белки и ДНК могут быть выделены из интерфазы и органической фазы. ДНК может быть выделена из интерфазы и нижней органической фазы с помощью этанола, а белки могут быть выделены из супернатанта преципитацией с изопропанолом.

R6G фосфорамидит для олигонуклеотидного синтеза, чистый 6-изомер. R6G (родамин 6G) — ксантеновый краситель родаминового ряда. Обладает высоким квантовым выходом флуоресценции и высоким коэффициентом молярной экстинкции. Максимумы поглощения и испускания 6-R6G смещены относительно максимумов флуоресцеина в длинноволновую область и находятся на 518 нм и 542 нм соответственно. R6G может использоваться в качестве акцептора FRET-пары в ДНК-секвенировании и анализе коротких тандемных повторов (STR). Краситель часто используется для получения TaqMan зондов для количественной ПЦР. В сравнении с красителями HEX и JOE, R6G обладает более сильным тушением в зондах типа «молекулярный маяк» в комбинации с тушителем BHQ1, что значительно снижает фоновую флуоресценцию в ПЦР.

CPG с остатком биотина может быть использовано для введения биотина по 3′ положению в твердофазном синтезе. Модифицирующий агент Биотин (гидроксипролинол) CPG 1000 принадлежит к Pro-серии продуктов на основе гидроксипролинола в остове молекулы. Размер пор носителя 1000 Å рекомендуется для синтеза олигонуклеотидов длиной до 120 оснований. Молекула биотин (гидроксипролинол) CPG содержит диметокситритиловую защиту (DMT), что делает возможной последующую очистку.

Флуоресцеин (FAM) - ксантеновый краситель, родоначальное соединение класса флуоресцеинов. Это производное флуоресцеина - гидразид для конъюгации с карбонильными соединенями (альдегидами и кетонами). Флуоресцеин - яркий флуорофор, совместимый с различным оборудованием для детекции флуоресценции. Углеводы также часто метят с помощью гидразидов - в этом случае их сначала окисляют периодатом до карбонильных соединений, затем вводят в реакцию с гидразидным производным красителя.

ВМР – это плейотропные ростовые факторы, принадлежащие к суперсемейству β-трансформирующего фактора роста (TGF-β), действующие в зависимости от концентрации и от микроокружения в локальной области. Основной функцией ВМР в организме принято считать индукцию формирования новой костной ткани. Доказано, что BMP-2 индуцирует дифференцировку мезенхимальных клеток в хондрогенные и остеогенные клетки, а также способствует пролиферации остеобластов. ВМР являются трансмембранными димерными белками. Данная конформация важна для биологической активности in vivo. Зрелый мономер ВМР состоит из 120 аминокислотных остатков, включающих в себя семь каноничных цистеиновых остатков, образующих цистеиновый узел в центре белка. Димеры ВМР стабилизированы дисульфидными связями (по три связи внутри каждого мономера и одна – между мономерами).

Окрашивание по Нисслю — широко используемый гистологический метод визуализации морфологии нервной ткани. Метод основан на взаимодействии основных красителей с нуклеиновыми кислотами клеток. Из-за интенсивного синтеза белка, перикарион нейронов имеет высокое содержание рибосомальной РНК в шероховатом эндоплазматическом ретикулуме (т.н. «вещество Ниссля»), и в следствие этого, окрашивание нейронов основными красителями в цитоплазме более выражено, чем в ядрах. На этом основании окрашенные по Нисслю нейроны можно отличить от глиальных клеток, а данный метод считается специфичным для обнаружения нейронов. Deep-Red Fluorescent Nissl Stain — непроникающий в живые клетки краситель, который не флуоресцирует в отсутствие нуклеиновых кислот. Краситель многократно усиливает свою флуоресценцию при связывании с РНК и ДНК. Длинноволновая флуоресценция Deep-Red Fluorescent Nissl Stain сильно отстоит от зеленого и красного каналов, что делает этот краситель идеальным для экспериментов с многоцветным флуоресцентным мечением.

LumiMount DAPI — заливочная среда на водной основе, содержащая DAPI (4’,6-диамидино-2-фенилиндол), для заключения под покровные стекла и визуализации флуоресцентно меченных образцов клеток или тканей. DAPI — синий флуоресцентный краситель, который прочно связывается с участками ДНК, богатыми аденином и тимином, и используется для контрастирования клеточных ядер, а также для окрашивания хромосом. DAPI демонстрирует ~20-кратное усиление флуоресценции при связывании с двухцепочечной ДНК с максимумами поглощения при 358 нм и испускания при 461 нм. LumiMount DAPI совместим с большинством флуоресцентных маркеров, используемых в микроскопии. Он препятствует выцветанию флуорохромов во время визуализации благодаря содержанию специального anti-fade агента. Коэффициент преломления жидкой заливочной среды составляет 1.38, но данный показатель может увеличиваться до 1.46 по мере испарения воды из-под покровного стекла. LumiMount DAPI обеспечивает полупостоянную герметизацию препаратов, достаточную для их длительного хранения при температуре от +2°C до +8°C. Поскольку LumiMount DAPI растворяется в воде, покровное стекло можно снять, погрузив препарат в раствор PBS до тех пор, пока покровное стекло не отделится. Для большей герметизации препарата рекомендуется заклеивать края покровного стекла водонепроницаемым лаком.

5-Винилуридин (VU) представляет собой производное уридина с концевой алкеновой группой, использующееся для исследования и мониторинга транскрипции РНК в клетках вместо 5-этинилуридина (EU). Винилуридин легко поглощается живыми клетками и включается РНК-полимеразами вместо эндогенного уридина в новосинтезированные молекулы РНК, но не в ДНК [1]. Синтезированная de novo РНК, меченная винилуридином, может быть затем обнаружена с помощью быстрой и высокочувствительной реакции циклоприсоединения с обращенными электронными требованиями Дильса-Альдера (IEDDA) между винильной группой и флуоресцентно- или биотин-меченым тетразином. Меченую РНК можно детектировать затем с помощью различных методов оценки уровня клеточной транскрипции, например, методами флуоресцентной микроскопии или проточной цитометрии.

AF 488 – флуоресцентный краситель. AF 488 является нечувствительным к pH среды флуорофором в диапазоне от 4 до 10. AF 488 имеет максимум поглощения при 495 нм, эмиссии – при 519 нм, что соответствует зеленой области спектра. Краситель гидрофилен и применяется для введения флуоресцентной метки в различные молекулы, в том числе белки и антитела. Конъюгаты молекул с AF 488 широко используются в проточной цитометрии и микроскопии, обладая высокой яркостью и фотостабильностью. Это позволяет детектировать биологические объекты с высокой чувствительностью при более длительных периодах съемки. Азид AF 488 взаимодействует с алкинильными производными биомолекул в реакциях Click Chemistry, как в присутствии медного (I) катализатора – с терминальными алкинами, так и без катализатора – с циклооктинами, приводя к образованию устойчивых аддуктов.

sulfo-Cyanine3.5 — краситель с флуоресценцией в оранжевой области спектра (максимум поглощения на 576 нм, максимум испускания на 603 нм). Спектры поглощения и испускания данного флуорофора находятся между спектрами красителей Cyanine3 и Cyanine5. По этой причине sulfo-Cyanine3.5 часто используется в качестве FRET-донора в паре с Cyanine5 и качестве FRET-акцептора в паре с Cyanine3, а также в экспериментах BRET. sulfo-Cyanine3.5 — сульфированное производное с 4 сульфогруппами в составе красителя, что обеспечивает высокую гидрофильность реагента и позволяет проводить все реакции с ним в водных растворах, без добавления органических растворителей. Данный реагент — алкиновое производное красителя sulfo-Cyanine3.5 для медь-катализируемой клик-реакции. Терминальная алкинильная (ацетиленовая) группа позволяет конъюгировать флуорофор с молекулами, содержащими азидную группу, посредством реакции 3+2-диполярного циклоприсоединения в присутствии катализатора на основе меди(I).

Производное бордипиррометенового (BDP) флуорофора, обладающий яркой флуоресценцией в газовой фазе. Пары 3,5-диметил-BDP обладают флуоресценцией, которую можно легко увидеть невооруженным глазом при возбуждении светодиодной лампой с длиной волны 365 нм. Яркая флуоресценция летучих красителей BDP представляет собой уникальное свойство. Возбуждение флуоресценции в газофазных системах при длине волны 494 нм, испускание при 499 нм. Таким же свойством, характерным для газофлуоресциющих BDP, обладает и BDP 505/515 краситель для липидов (в газовой фазе λmax(ex) = 492 nm; λmax(em) = 497 nm).

DusQ 1 фосфорамидит содержит нефлуоресцирующий тушитель с широким спектром поглощения, который перекрывает спектры флуоресценции в жёлтой и зелёной части спектра. Этот продукт используется для синтеза дважды меченых зондов для количественной ПЦР с тушителем DusQ 1 на 5’-конце и в других областях применения тушения по механизму FRET для мультиплексного анализа. Данный фосфорамидит имеет DMT-защиту гидроксиметильной группы, и может использоваться для очистки на картридже. Для DusQ 1 характерно поглощение в диапазоне 480 - 580 нм, что можно использовать для создания зондов для количественной ПЦР в сочетании с распространенными репортерами, такими как FAM, TET, JOE, HEX, Cyanine3 с целью формирования комплексов с высокой эффективностью тушения.