Поиск

Набор реагентов «ALSENSE Phytoplasma mali» предназначен для обнаружения специфической ДНК Phytoplasma mali методом ПЦР на основе использования технологии TaqMan в препаратах нуклеиновых кислот. Принцип действия набора реагентов «ALSENSE» для выявления Phytoplasma mali методом ПЦР-РВ заключается в проведении полимеразной цепной реакции в режиме реального времени (ПЦР-РВ) с гибридизационно-флуоресцентной детекцией на матрице ДНК. В основе метода ПЦР лежит многократное удвоение определённого участка ДНК при помощи ДНК-полимеразы в искусственных условиях (in vitro). Мишенью для амплификации является участок гена 16S рибосомной РНК фитоплазм группы 16SrX. Внутренний контроль (ВКО) разработан на основе последовательностей генов 18S рибосомной РНК яблони. Зонд TaqMan к участку генома Candidatus Phytoplasma mali несет на 5’-конце метку-краситель FAM. ВКО-специфичный зонд мечен флуорофором HEX, что позволяет пользователю валидировать этап экстракции ДНК из растений.

Описание: 100 mM раствор литиевой соли 2`-дезоксицитидин-5`трифосфорной кислоты в воде. Используется в массовых рутинных ПЦР с небольшой, главным образом до 3 тыс. пар нуклеотидов, длиной продуктов. Тестировано в ПЦР для получения продуктов длиной более 15 тыс. пар нуклеотидов с ДНК фага Т7 в качестве матрицы Способ получения: Химический синтез Условия хранения: Хранить при -20°С Хроматографическая чистота не менее 96%. Определяется на HPLC (Column ProntoSIL-120-5-C18AQ) Коэффициент экстинкции: 9300 M-1 X см-1 при λmax = 271 нм Контроль качества: Тест на отсутствие примесей РНКаз: После инкубации смеси dNTP в течение 30 минут с флуоресцентно меченным олигонуклеотидом гидролиза не наблюдается. Тест на отсутствие примесей эндо- и экзодезоксирибонуклеаз и фосфатаз: После инкубации смеси dNTP в течение 3-х часов с одно- и двуцепочечными олигонуклеотидами гидролиза не наблюдается.

Сайт узнавания и позиция гидролиза: GCCGGC G↑CCGGC CGGCCG CGGCC↓G Источник: Micrococcus roseus N0 Определение единицы активности: За единицу активности принимается количество фермента, необходимое для гидролиза 1 мкг ДНК аденовируса-2 за 1 час при 37°С в 50 мкл реакционной смеси. Субстрат для определения активности: ДНК аденовируса-2 Оптимальный буфер: SE-буфер B Активность фермента в различных буферах в процентах от максимальной: B G O W Y ROSE 100 50 10 10 5 Условия хранения: 10 mM Tris-HCl (pH 7.5); 250 mM NaCl; 0.1 mM EDTA; 200 ug/ml BSA; 7 mM2-меркаптоэтанол; 50% глицерин; Хранить при -20°С. Лигирование: После гидролиза 5-кратным избытком фермента более 90% фрагментов ДНК Ad-2 сшиваются ДНК-лигазой и могут быть повторно расщеплены. Неспецифический гидролиз: Картина специфического гидролиза не изменяется при обработке 1 мкг ДНК 10 ед фермента в течение 16 часов при 37°С. Чувствительность к метилированию: не проверялось С ферментом поставляется: 10 Х SE-буфер B.

Описание: Представляет собой смесь специальных плазмид гидролизованных определенными ферментами с образованием 12 фрагментов пригодных для использования в качестве стандарта молекулярных весов в агарозном гель-электрофорезе. Длины фрагментов Длина фрагмента, п.н. Масса ДНК, нг Длина фрагмента, п.н. Масса ДНК, нг 3000 120 600 80 2000 120 500 100 1000 160 400 50 900 120 300 30 800 110 200 20 700 70 100 20 Условия хранения: 10 mM Tris-HCl (pH 7.8); 1 mM EDTA; 50mM NaCl. Хранить при – 20°С. Примечание: ДНК маркер не предназначен для определения количества ДНК, однако может быть использован для приблизительной оценки путем сравнения интенсивности фрагментов одинакового размера. Мы рекомендуем наносить 1 мкг ДНК маркера на дорожку. Перед использованием в ДНК маркер добавить1/10 объема SE-буфера для нанесения с красителем. Маркер с красителем может храниться при 4-8°С в течение 6 месяцев.

Тест-система для выявления ДНК генетически модифицированной сои линии FG-72 в продуктах питания и кормах для животных методом ПЦР.

QuantumDNA-Set состоит из 3-х наборов: QuantumDNA-91, -156 и -211. Наборы QuantumDNA предназначены для количественной и качественной оценки геномной ДНК человека. С помощью QuantumDNA устанавливают концентрацию пригодных для ПЦР фрагментов. Это эффективная концентрация ДНК, которая часто расходится с абсолютной. Оценка с помощью QuantumDNA позволяет: − отбраковать образцы с низкой эффективной концентрацией ДНК или с ингибиторами ПЦР. Это сэкономит время и реагенты целевой ПЦР, снизит риск ложноотрицательных результатов анализа; − рассчитать оптимальное количество ДНК для целевой реакции. Это повысит воспроизводимость и надежность результатов целевой ПЦР.

dsGreen - очень чувствительный и специфичный краситель для детекции двухцепочечной ДНК. Благодаря этому его можно использовать в качестве универсального реагента для флуоресцентной детекции амплификации в ПЦР реального времени. Для этого не требуется использовать флуоресцентно меченые зонды - достаточно праймеров из природных нуклеотидов. Эта форма dsGreen специально создана для ПЦР режима реального времени. Ее отличия состоят в следующем: Концентрация красителя постоянна от партии к партии, поэтому результаты воспроизводимы Каждая партия красителя протестирована в ПЦР Низкая интенсивность фоновой флуоресценции, хорошее разгорание.

Сайт узнавания: (5mC)G Источник: из штамма E.coli, содержащего клонированный ген ДНК метилтрансферазы SssI из Spiroplasma species strain MQ1. Описание: Модифицирует остатки цитозина (C5) в последовательности узнавания 5’-CG- 3’. Определение единицы активности: За одну единицу активности принимают количество фермента, необходимое для защиты 1 мкг ДНК фага Лямбда за 1 час при 37ºC в 20 мкл реакционной смеси от гидролиза эндонуклеазой рестрикции BstFNI (5’-CGCG- 3’). Реакционный буфер: SE-буфер O + SAM Условия хранения: 10 mМ Tris-HCl (pH 7.4), 0.1 mМ EDTA, 10 mМ 2-меркаптоэтанол, 100 mМ NaCl и 50% глицерин. Хранить при -20°С. Примечание: Для достижения 100% активности SAM следует добавлять в реакционную смесь до концентрации 160 μM.

SNPdetect — термостабильная высокоточная ДНК-полимераза с «горячим стартом», лишена экзонуклеазной активности. SNPdetect используется для детекции однонуклеотидных полиморфизмов (SNP) и специфичной амплификации фрагментов ДНК длиной до 1 000 п.о. Область применения: • SNP генотипирование: аллель-специфичная ПЦР (AS-PCR), аллель-специфичное удлинение праймера (AS-PEX). • Высокоспецифичная ПЦР, в том числе мультиплексная ПЦР. • ПЦР-РВ с изменением конформации зондов без его разрушения, например, технологии Scorpion, Amplifluor, LUX и др. • HRM, плавление с использованием меченных и немеченных зондов. • ПЦР-РВ с интеркалирующими красителями.

Сайт узнавания и позиция гидролиза: AATATT AAT↑ATT TTATAA TTA↓TAA Источник: Из штамма E.coli несущего клонированный ген Ssp I из Sphaerotilus species Определение единицы активности: За единицу активности принимается количество фермента, необходимое для гидролиза 1 мкг ДНК фага лямбда за 1 час при 37°С в 50 мкл реакционной смеси. Субстрат для определения активности: ДНК фага лямбда Оптимальный буфер: SE-буфер K Активность фермента в различных буферах в процентах от максимальной: B G O W Y ROSE 75 50 25 50 75 100 Условия хранения: 10 mM Tris-HCl (pH 7.5); 200 mM NaCl; 0,1 mM EDTA; 1 mM DTT; 200 μg/ml BSA; 50% глицерин; Хранить при -20°С. Лигирование: После гидролиза 10-кратным избытком фермента 90% фрагментов ДНК сшиваются T4 ДНК-лигазой и могут быть повторно расщеплены. Неспецифический гидролиз: Картина специфического гидролиза не изменяется при обработке 1 мкг ДНК 10 ед фермента в течение 16 часов при 37°С. Чувствительность к метилированию: Блокируется метилированием AmATATT. С ферментом поставляется: 10 Х SE-буфер K, BSA. Для фасовок Turbo прикладывается 10 X SE-буфер ROSE+. Примечание: Большой избыток фермента приводит к появлению звездчатой активности. Для достижения 100% активности BSA следует добавлять в реакционную смесь до концентрации 100 мкг/мл. BSA при длительной инкубации использовать не рекомендуется.

Сайт узнавания и позиция гидролиза: GCNGC GC↑NGC CGNCG CGN↓CG Источник: Из штамма E.coli несущего клонированный ген Fsp4H I из Flavobacterium species 4H Определение единицы активности: За единицу активности принимается количество фермента, необходимое для гидролиза 1 мкг ДНК фага лямбда за 1 час при 37°С в 50 мкл реакционной смеси. Субстрат для определения активности: ДНК фага лямбда Оптимальный буфер: SE-буфер Y Активность фермента в различных буферах в процентах от максимальной: B G O W Y ROSE 50 75 10 25 100 100 Условия хранения: 10 mM Tris-HCl (pH 7.5); 100 mM NaCl; 0.1 mM EDTA; 200ug/ml BSA; 1mM DTT; 50% глицерин; Хранить при -20°С. Лигирование: После гидролиза 5-кратным избытком фермента 5% фрагментов ДНК сшиваются Т4 ДНК-лигазой и могут быть повторно расщеплены. Неспецифический гидролиз: Картина специфического гидролиза не изменяется при обработке 1 мкг ДНК 5 ед фермента в течение 16 часов при 37°С. Чувствительность к метилированию: Блокируется метилированием: 5`-G(5mC)NGC-3`/ 3`-CGN(5mC)G-5` С ферментом поставляется: 10 Х SE-буфер Y. Для фасовок Turbo прикладывается 10 X SE-буфер ROSE.

Сайт узнавания и позиция гидролиза: GAATTC G↑AATTC CTTAAG CTTAA↓G Источник: Из штамма E.coli несущего клонированный ген EcoR I из Escherichia coli Определение единицы активности: За единицу активности принимается количество фермента, необходимое для гидролиза 1 мкг ДНК фага лямбда за 1 час при 37°С в 50 мкл реакционной смеси. Субстрат для определения активности: ДНК фага лямбда Оптимальный буфер: SE-буфер EcoRI Активность фермента в различных буферах в процентах от максимальной: B G O W Y ROSE 50 75 75 75 50 50 Условия хранения: 10 mM Tris-HCl (pH 7.5); 200 mM NaCl; 0.1 mM EDTA; 7 mM 2-меркаптоэтанол; 200 μg/ml BSA; 50% глицерин; Хранить при -20°С. Лигирование: После гидролиза 40-кратным избытком фермента более 90% фрагментов ДНК сшиваются ДНК-лигазой и могут быть повторно расщеплены. Неспецифический гидролиз: Картина специфического гидролиза не изменяется при обработке 1 мкг ДНК 40 ед фермента в течение 16 часов при 37°С. Чувствительность к метилированию: не проверялось С ферментом поставляется: 10 Х SE-буфер EcoRI, BSA (кроме E057T и E058T). Для фасовок Turbo (E057T и E058T) прикладывается только буфер ROSE. Примечание: При большом избытке фермента, при использовании неоптимального буфера возможно появление звездчатой активности. Длительная инкубация c BSA не рекомендуется из-за появления звездчатой активности. Для достижения 100% активности BSA следует добавлять в реакционную смесь до концентрации 100 мкг/мл. BSA при длительной инкубации использовать не рекомендуется.