Биореактивы

Окрашенная реакционная смесь 5X ScreenMix-HS (UDG) предназначена для проведения ПЦР с последующим электрофоретическим анализом продукта в агарозном геле. В состав смеси входят UDG (урацил-ДНКгликозилаза) и нуклеотиды dUTP. На первом этапе фермент UDG разрушает все ранее амплифицированные ПЦР-продукты по включенным остаткам dUTP, что предотвращает кросс-контаминацию. В состав 5X ScreenMix-HS (UDG) входят все необходимые компоненты ПЦР: Taq ДНК-полимераза с «горячим стартом», UDG, смесь dNTP (включая dUTP в оптимальной пропорции), ионы Mg2+, ПЦР буфер, глицерин, красители (красный и желтый). Красители и глицерин позволяют после прохождения ПЦР напрямую наносить реакционную смесь на гель для проведения электрофореза. Для постановки реакции ПЦР в смесь требуется добавить только праймеры, ДНК-матрицу и воду.

Пирен - это один из простейших полиароматических углеводородов (ПАУ). Некоторые производные пирена известны способностью к интеркаляции с ДНК. Производные пирена флуоресцируют. Когда два остатка сирена сближены в пространстве, с помощью метода флуоресцентной спектроскопии можно наблюдать образование эксимеров - возбужденных димеров. Поэтому пирен можно использовать для получения информации о структуре биомолекул. Молекула этинилпирена содержит концевую тройную связь, способную вступать в реакцию Cu(I)-катализируемого диполярного циклоприсоединения, а также в Pd(0)-катализируемую реакцию Соногаширы.

Носитель для синтеза ДНК/РНК — стекло контролируемой пористости для синтеза 3’-модифицированных олигонуклеотидов. Подходит для синтеза олигонуклеотидов длиной до 100 мер. Модификация совместима со стандартными условиями деблокирования олигонуклеотидов — аммиаком, смесью аммиак-метиламин и другими основными реагентами.

Сайт узнавания и позиция гидролиза: GAAGA(N)8 GAAGA(N)8↑ CTTCT(N)7 CTTCT(N)7↓ Источник: Из штамма E.coli несущего клонированный ген Mbo II из Moraxella bovis Определение единицы активности: За единицу активности принимается количество фермента, необходимое для гидролиза 1 мкг ДНК фага лямбда (dam-) за 1 час при 37°С в 50 мкл реакционной смеси. Субстрат для определения активности: ДНК фага лямбда (dam-) Оптимальный буфер: SE-буфер Y Активность фермента в различных буферах в процентах от максимальной: B G O W Y ROSE 75 75 25 50 100 50 Условия хранения: 10 mM Tris-HCl (pH 7.5); 50 mM NaCl; 0,1 mM EDTA; 1 mM DTT; 200 μg/ml BSA; 50% глицерин; Хранить при -20°С. Лигирование: После гидролиза 5-кратным избытком фермента около 60% фрагментов ДНК сшиваются ДНК-лигазой и могут быть повторно расщеплены. Сшивка более эффективна в присутствии 10% ПЭГ. Неспецифический гидролиз: Картина специфического гидролиза не изменяется при обработке 1 мкг ДНК 5 ед фермента в течение 16 часов при 37°С. Чувствительность к метилированию: Блокируется при перекрывании dam-метилированием (GmATC): GAAGATC. С ферментом поставляется: 10 Х SE-буфер Y.

Сайт узнавания и позиция гидролиза: (N)8AAGNNNNNCTT(N)13 ↑(N)8AAGNNNNNCTT(N)13↑ (N)13TTCNNNNNGAA(N)8 ↓(N)13TTCNNNNNGAA(N)8↓ Источник: Flavobacterium aquatile Ob10 Определение единицы активности: За единицу активности принимается количество фермента, необходимое для гидролиза 1 мкг ДНК фага лямбда за 1 час при 37°С в 50 мкл реакционной смеси. Субстрат для определения активности: ДНК фага лямбда Оптимальный буфер: SE-буфер W + SAM Активность фермента в различных буферах в процентах от максимальной: B G O W Y ROSE 25 75 100 50 70 Условия хранения: 10 mM Tris-HCl (pH 7.5); 250 mM NaCl; 0,1 mM EDTA; 200 ug/ml BSA; 7 mM 2-меркаптоэтанол; 50% глицерин; Хранить при -20°С. Лигирование: После гидролиза 3-кратным избытком фермента 20% фрагментов ДНК сшиваются ДНК-лигазой и 80% из них могут быть повторно расщеплены. В присутствии 10% ПЭГ сшивка проходит лучше Неспецифический гидролиз: Картина специфического гидролиза не изменяется при обработке 1 мкг ДНК 5 ед фермента в течение 16 часов при 37°С Чувствительность к метилированию: не проверялось С ферментом поставляется: 10 Х SE-буфер W, SAM. Примечание: Большой избыток фермента приводит к появлению звездчатой активности. Для достижения 100% активности SAM следует добавлять в реакционную смесь до концентрации 0.01 mM.

Маркер длин ДНК 100+ bp — стандарт для определения длины двухцепочечных молекул ДНК в диапазоне от 100 до 1500 п.о. в агарозном геле. «DNA Ladder 100+ bp» может быть использован для приблизительной оценки массы фрагмента ДНК в образце путем сравнения интенсивности полос одинаковой длины. «4Х Gel Loading Dye, Blue» предназначен для нанесения маркера длин и исследуемых образцов на гель.

3-Малеимидпропионовой кислоты NHS-эфир представляет собой проникающий сквозь мембраны, нерасщепляемый бифункциональный сшивающий агент. Он содержит гидроксисукцинимидную (NHS) для реакции с аминами, и малеимидную группы для реакции с тиоловыми группами. Благодаря NHS-группе линкер может быть присоединен практически к любой первичной или вторичной аминной группе белков, пептидов или низкомолекулярных аминов. Малеимидный фрагмент обеспечивает легкое присоединение к белкам и пептидам через SH-остатки цистеина, а также к другим тиолированным молекулам, таким как тиолсодержащие олигонуклеотиды. Реагент также используется для синтеза in situ химически нестабильного азида-ПЭГ4-малеимида.

MD ДНК эндонуклеаза Bls I. Метилзависимая ДНК эндонуклеаза отличается от эндонуклеаз рестрикции тем, что режет ДНК исключительно при наличии метильных групп в сайте узнавании. При отсутствии метилирования гидролиз отсутствует Сайт узнавания и позиция гидролиза: G(5mC)NGC G(5mC)N↑GC (5mC)GN(5mC)G (5mC)G↓N(5mC)G Источник: Bacillus simplex 23 Определение единицы активности: За одну единицу активности принимается количество фермента, необходимое для полного гидролиза, как минимум, одного сайта 5`-G(5mC)NG(5mC)-3`/3`-CGN(5mC)G-5` в 1 мкг линейной формы плазмиды pFsp4HI3/DriI за 1 час при 30°С в 50 мкл реакционной смеси. При этом происходит исчезновение исходной линейной формы плазмиды pFsp4HI3/DriI (см. рисунок ниже, дор. 4). Субстрат для определения активности: Субстрат pFsp4HI3/DriI представляет собой ДНК плазмиды pFsp4HI3, линеаризованной эндонуклеазой рестрикции DriI. Плазмида pFsp4HI3 содержит фрагмент геномной ДНК бактериального штамма Flavobacterium sp. 4H, включающий ген ДНК-метилтрансферазы M.Fsp4HI, и три канонических сайта: 5`-G(5mC)NG(5mC)-3`/3`-CGN(5mC)G-5`[2, 3]. Оптимальный буфер: SE-буфер W Активность фермента в различных буферах в процентах от максимальной: B G O W Y ROSE 10 10 50 100 75 50 Условия хранения: 10 mM Tris-HCl (pH 7.5); 200 mM NaCl; 0.1 mM EDTA; 7 mM 2-меркаптоэтанол;200 μg/ml BSA; 50% глицерин. Хранить при -20°С. Лигирование: Неспецифический гидролиз: Не наблюдается неспецифического гидролиза при инкубации 5 ед фермента Bls I с 1 мкг ДНК фага лямбда в течение 16 часов при 30°С в 50 мкл реакционной смеси. Чувствительность к метилированию: Фермент расщепляет только метилированную ДНК. Не расщепляет немодифицированную ДНК. С ферментом поставляется: 10 Х SE-буфер W.

Набор CleanRNA Standard предназначен для очистки препаратов суммарной РНК, полученных после выделения реагентом ExtractRNA (кат. # BC032, Евроген) или его аналогами (TRIzol, TRI Reagent), из реакционных смесей, а также для концентрирования РНК. Набор CleanRNA Standard позволяет очистить образец от низкомолекулярной фракции РНК (размером менее 250 нуклеотидов), в т.ч. от транспортной РНК. Очищенная РНК может содержать примеси геномной ДНК, если предварительно не проводилась обработка ДНКазой. Очищенная РНК подходит для синтеза кДНК и анализа экспрессии генов методом ОТ-ПЦР, пробоподготовки для NGS, Нозерн-блота, трансляции in vitro и других молекулярно-биологических приложений.

Позволяет определять общий белок в моче в диапазоне от 0, 05 г/л до 4 г/л без дополнительных разведений. Для работы используется малый объем биологического материала - 20 мкл. Время инкубации проб всего 10 мин при температуре 18-25оС или 37оС. Срок годности калибратора после вскрытия флакона - до 3 месяцев при 4-8оС. Возможность использования на фотометрах любого типа. Все компоненты набора готовы к использованию.

Реакционная смесь 5X qPCRmix-HS SYBR предназначена для ПЦР в реальном времени с интеркалирующим красителем SYBR Green I. В состав 5X qPCRmix-HS SYBR входят все необходимые компоненты для ПЦР: высокопроцессивная Taq ДНК полимераза со специфическими моноклональными антителами, краситель SYBR Green I, смесь дезоксинуклеозидтрифосфатов, Mg2+, ПЦР буфер. Для постановки реакции ПЦР в смесь требуется добавить праймеры, матрицу ДНК и воду. 5X qPCRmix-HS SYBR подходит для Real-Time амплификаторов любого типа.