Биореактивы

3,5-бис-[(E)-2-фенилэтенил]-BDP — это соединение симметричного строения из ряда бис(гетеро)арилэтенил-замещённых дифторидов дипиррометенбора. В молекуле присутствуют в транс-конфигурации относительно двойных связей две фенилэтенильные группы, что делает данное производное красителя BDP в значительной степени липофильным. Это нефункционализированное производное BDP может использоваться в микроскопии для проникновения внутрь клетки и окрашивания липидов. Производные флуорофора BDP обладают высокими квантовым выходом и фотохимической стабильностью, и могут применяться в качестве флуорогенных зондов для индикации липидных капель. Для производных с расширенной π-электронной системой благодаря введению ароматических, алкенильных или алкинильных заместителей в 3- и 5-положении дипирринового остова характерен сдвиг эмиссионного спектра в красную область по сравнению с большинством маркеров липидных капель из ряда классических красителей семейства бордипиррометена.

Пирен - полициклический ароматический углеводород, обладающий коротковолновой флуоресценцией. В отличие от других флуорофоров, он обладает большой чувствительностью к микроокружению - его флуоресценция в полярных и в неполярных окружениях различается. Когда два остатка пирена находятся рядом друг с другом, они образуют эксимеры (excited dimers - "возбужденные димеры"). Образование эксимеров может быть обнаружено и количественно оценено с помощью спектров флуоресценции. Эксимеры отличаются более длинноволновой флуоресценцией. Пирен азид - реагент для введения остатка пирена с помощью клик-химии. Этот реагент содержит линкер на основе триэтиленгликоля для увеличения гидрофильности и растворимости реагента и упрощения конъюгации с биомолекулами в водных средах.

ДБЦО-ПЭГ6-NHS-эфир — бифункциональный линкер, содержащий дибензоциклооктин (ДБЦО) и остаток N-гидроксисукцинимида на концах полимерного спейсера ПЭГ6 (гексаэтиленгликоля). Спейсер ПЭГ6 увеличивает растворимость реагента в водной среде и обеспечивает длинное и гибкое присоединение функциональных групп, сводящее к минимуму стерические затруднения, возникающие при лигировании. Дибензоциклооктин легко реагирует с азидами посредством безмедной клик-реакции (SPAAC). ДБЦО — один из наиболее реакционноспособных циклоалкинов, не реагирующий с тетразинами. Остаток N-гидроксисукцинимида (NHS) используется для связывания с первичными аминами белков, пептидов, модифицированных амином олигонуклеотидов и другими молекулами, содержащими амины.

Сульфотетрафторфениловый эфир дибензоциклооктина (STP-эфир ДБЦО) — это растворимый в воде реагент, который используется для модификации пептидов, антител, белков и других биомолекул, содержащих -NH2 группу. STP-эфиры гораздо медленнее гидролизуются по сравнению с NHS-эфирами, что позволяет более эффективно проводить модификацию биомолекул в водной среде. Дибензоциклооктиновый фрагмент (ДБЦО, DBCO), также известный как ADIBO или DIBAC, является наиболее часто используемым субстратом для безмедных клик-реакций, которые промотируются напряжением цикла. В такой реакции производные DBCO в отсутствие Cu (I) катализатора реагируют с биомолекулами, функционализированными азидной группой, приводя к образованию стабильных триазолов.

BDP TMR - это краситель для канала TAMRA. В отличие от оригинального красителя TAMRA у него высокий квантовый выход и соответственно, высокая яркость. Данное производное BDP TMR содержит первичную аминогруппу, которая может быть конъюгирована с различными электрофилами, а также может участвовать в катализируемой энзимами реакции трансаминирования.

TODi-1 (гомодимер Тиазолового Оранжевого, также известный как TOTO®-1) — димерный краситель на основе карбоцианина с флуоресценцией в зеленой части спектра. TODi-1 — непроникающий в живые клетки ядерный краситель, который не флуоресцирует в отсутствие нуклеиновых кислот. Краситель значительно усиливает свою флуоресценцию при связывании с двуцепочечной ДНК. TODi-1 идеален для окрашивания нуклеиновых кислот на микрочипах, а также для контрастного окрашивания ядер и хромосом в экспериментах с многоцветным флуоресцентным мечением благодаря яркому сигналу и низкой фоновой флуоресценции. TODi-1 не цитотоксичен и может использоваться для долгосрочного мониторинга жизнеспособности клеток и обнаружения мертвых клеток в культуре.

TMRE широко используется для окрашивания митохондрий в живых клетках и не подходит для протоколов с фиксацией клеток. Этот липофильный и положительно заряженный краситель проникает через плазматическую мембрану клеток, при этом не взаимодействуя с мембранными белками и не образуя агрегатов. Краситель TMRE селективно накапливается в активных митохондриях благодаря трансмембранному потенциалу, который митохондрии поддерживают в нормальном состоянии. Кроме окрашивания митохондрий для их визуализации, TMRE используется для количественной оценки митохондриального мембранного потенциала с помощью уравнения Нернста. Краситель служит инструментом для изучения изменений функционирования митохондрий и жизнеспособности клеток в ответ на исследуемые агенты. Деполяризация митохондрий вследствие запуска процессов апоптоза, некроза или других факторов характеризуется уменьшением мембранного потенциала и, как следствие, уменьшением накопления красителя и его флуоресценции, по сравнению с интактными клетками, имеющими поляризованные митохондрии. Краситель TMRE применяется в флуоресцентной микроскопии, проточной цитофлуориметрии, экспериментах с использованием планшетных ридеров. Краситель имеет максимум возбуждения при 549 нм — он совместим с голубым (488 нм) и желто-зеленым (561 нм) лазерами. Флуоресценция красителя детектируется в канале фикоэритрина (PE) (максимум при 574 нм).

BDP 650/665 — бордипиррометеновый краситель с поглощением и эмиссией в дальней красной области. Он обладает высоким коэффициентом экстинкции и хорошим квантовым выходом. Активированный эфир можно конъюгировать с аминогруппами белков, пептидов и других молекул. Этот активированный эфир содержит дополнительный линкер на основе аминогексановой кислоты.

ProbeMaster® ROX — готовая 5-кратная реакционная смесь, содержащая все необходимые компоненты для проведения количественной ПЦР с применением интеркалирующих красителей или гидролизуемых зондов. Eе состав оптимизирован для получения идеальных результатов с минимальным значением порогового цикла и высоким уровнем отношения сигнал/фон. Формат готовой реакционной смеси снижает риск контаминации образцов. ProbeMaster® ROX позволяет решать большое количество задач с минимальными затратами времени. Смесь подходит для точного определения содержания ДНК матрицы в пробе и может применяться для определения уровня копийности и экспрессии генов, генотипирования, детекции SNP и других приложений.

Биотин-ПЭГ3-азид — соединение для биотинилирования методом клик-химии. Реагент позволяет метить алкинилированные молекулы (такие как ДНК, олигонуклеотиды и белки) биотином с помощью катализируемой медью или безмедной клик-реакций. Биомолекулы, меченные биотином, могут быть затем связаны с авидином или стрептавидином для дальнейшей их очистки или детекции. Данное азидопроизводное содержит длинный гидрофильный ПЭГ3-линкер, который разделяет в пространстве остаток биотина и связанную с ним биомолекулу для более эффективного связывания биотина со стрептавидином. Линкер также увеличивает растворимость вещества в воде, что упрощает его конъюгацию. Данный азид может конъюгироваться со многими молекулами.

Бифункциональный ПЭГ2 кросс-линкер с терминальными алкинильной и алкилиодидной группами. Алкилиодиды являются одними из самых мощных алкилирующих агентов, они способны реагировать с различными O-, S-, N- и С-нуклеофилами. Подобные производные могут быть использованы для получения молекул с терминальными алкинильными группами. Терминальный алкин - универсальный синтон для реакции Соногаширы или клик-химии.

Cyanine5.5 - флуофор, обладающей эмиссией в дальней красной области. Он хорошо подходит для имиджинга in vivo и применений, требующих низкой фоновой флуоресценции. Это производное Cyanine5.5 содержит фрагмент тетразина, вступающий в реакцию с транс-циклооктенами, циклопропенами и некоторыми напряженными циклооктинами. Эта реакция конъюгации может проводиться in vivo.