Биореактивы

Сайт узнавания и позиция гидролиза: GACNNNNNNGTC GACNNNN↑NNGTC CTGNNNNNNCAG CTGNN↓NNNNCAG Источник: Из Deinococcus species D2 Определение единицы активности: За единицу активности принимается количество фермента, необходимое для гидролиза 1 мкг ДНК фага лямбда за 1 час при 37°С в 50 мкл реакционной смеси. Субстрат для определения активности: ДНК фага лямбда Оптимальный буфер: SE-буфер Y Активность фермента в различных буферах в процентах от максимальной: B G O W Y ROSE 75 75 25 50 100 30 Условия хранения: 10 mM Tris-HCl (pH 7.5); 50 mM KCl; 0.1 mM EDTA; 7 mM 2-меркаптоэтанол; 200 ug/ml BSA; 50% глицерин; Хранить при -20°С. Лигирование: После гидролиза 10-кратным избытком фермента более 90% фрагментов ДНК сшиваются ДНК-лигазой и могут быть повторно расщеплены Неспецифический гидролиз: Картина специфического гидролиза не изменяется при обработке 1 мкг ДНК 20 ед фермента в течение 16 часов при 37°С Чувствительность к метилированию: не проверялось С ферментом поставляется: 10 Х SE-буфер Y, BSA. Примечание: Для достижения 100% активности BSA следует добавлять в реакционную смесь до концентрации 100 мкг/мл. BSA при длительной инкубации использовать не рекомендуется.

Сайт узнавания и позиция гидролиза: YGGCCR Y↑GGCCR RCCGGY RCCGG↓Y Источник: Из штамма E.coli, несущего клонированный ген Acol из Acinetobacter calcoaceticusОпределение единицы активности: За единицу активности принимается количество фермента, способное гидролизовать 1 мкг ДНК фага лямбда за 1 час при 37°С в 50 мкл реакционной смеси в SE-буфере Y. Субстрат для определения активности: ДНК фага лямбда Оптимальный буфер: SE-буфер Y Активность фермента в различных буферах в процентах от максимальной: B G O W Y ROSE 50 75 50 25 100 100 Условия хранения: 10 mM Tris-HCl (pH 7.5); 200 mM NaCl; 0.1 mM EDTA; 7 mM 2-меркаптоэтанол;200 ug/ml BSA; 50% глицерин; Хранить при -20°С. Лигирование: После гидролиза 3-кратным избытком фермента 95% фрагментов ДНК сшиваются ДНК-лигазой и могут быть повторно расщеплены. Неспецифический гидролиз: Картина специфического гидролиза не изменяется при обработке 1 мкг ДНК 2 ед фермента в течение 16 часов при 37°С. Чувствительность к метилированию: Блокируется при перекрывании dcm-метилированием (CmCWGG):CCTGGCCR С ферментом поставляется: 10 Х SE-буфер Y.

Сайт узнавания и позиция гидролиза: ACTAGT A↑CTAGT TGATCA TGATC↓A Источник: Alteromonas haloplanktis SP Определение единицы активности: За единицу активности принимается количество фермента, необходимое для гидролиза 1 мкг ДНК фага T7 за 1 час при 37°С в 50 мкл реакционной смеси. Субстрат для определения активности: ДНК фага Т7 Оптимальный буфер: SE-буфер B Активность фермента в различных буферах в процентах от максимальной: B G O W Y ROSE 100 75 25 25 75 100 Условия хранения: 10 mM Tris-HCl (pH 7.5); 100 mM NaCl; 0.1 mM EDTA; 7 mM меркаптоэтанол; 200 ug/ml BSA; 50% глицерин; Хранить при -20°С. Лигирование: После гидролиза 20-кратным избытком фермента более 90% фрагментов ДНК фага T7 сшиваются ДНК-лигазой и могут быть повторно расщеплены. Неспецифический гидролиз: Картина специфического гидролиза не изменяется при обработке 1 мкг ДНК 40 ед фермента в течение 16 часов при 37LС. Чувствительность к метилированию: не проверялось С ферментом поставляется: 10 Х SE-буфер B, BSA (кроме E173T и E174T) Для фасовок Turbo (E173T и E174T) прикладывается только буфер ROSE. Примечание: Для достижения 100% активности BSA следует добавлять в реакционную смесь до концентрации 100 мкг/мл. BSA при длительной инкубации использовать не рекомендуется.

Описание: Мы предлагаем 10хSE-буферы, оптимизированные для работы с нашими ферментами. 10хSE-буферы обеспечивают оптимальные реакционные условия для достижения 100% активности, производимых нами ферментов (эндонуклеаз рестриции). Каждый фермент поставляется в комплекте с рекомендованным 10хSE-буфером. Некоторые ферменты требуют специфические реакционные условия, поэтому для них созданы индивидуальные кратные SE-буферы. Также некоторым эндонуклеазам рестриции для достижения 100% активности дополнительно требуется бычий сывороточный альбумин (BSA) или S-аденозил-L-метионин (SAM). Когда это необходимо, данные реактивы поставляются в комплекте с ферментом и 10хSE-буфером. Состав: 1X(20 mМ Глицин-NaOH (pH 9.5 при 25°C); 25 mM MgCl2; 100mM NaCl; 1mM 2-меркаптоэтанол) Условия хранения: Хранить при -20°C. С ферментом поставляется: 10 Х SE-буфер.

Сайт узнавания и позиция гидролиза: GTCGAC G↑TCGAC CAGCTG CAGCT↓G Источник: Из штамма E.coli несущего клонированный ген Sal I из Streptomyces albus Определение единицы активности: За единицу активности принимается количество фермента, необходимое для гидролиза 1 мкг ДНК фага лямбда (HindIII-digest) за 1 час при 37°С в 50 мкл реакционной смеси. Субстрат для определения активности: ДНК фага лямбда (HindIII-digest) Оптимальный буфер: SE-буфер O Активность фермента в различных буферах в процентах от максимальной: B G O W Y ROSE 10 100 25 5 Условия хранения: 10 mM Tris-HCl (pH 7.5); 50 mM NaCl; 0,1 mM EDTA; 1 mM DTT; 200 μg/ml BSA; 50% глицерин. Хранить при -20°С. Лигирование: После гидролиза 10-кратным избытком фермента более 90% фрагментов ДНК pUC19 сшиваются ДНК-лигазой и могут быть повторно расщеплены. Неспецифический гидролиз: Картина специфического гидролиза не изменяется при обработке 1 мкг ДНК 20 ед фермента в течение 16 часов при 37°С. Чувствительность к метилированию: не проверялось С ферментом поставляется: 10 Х SE-буфер O. Примечание: Большой избыток фермента приводит к появлению звездчатой активности.

Описание: Мы предлагаем 10хSE-буферы, оптимизированные для работы с нашими ферментами. 10хSE-буферы обеспечивают оптимальные реакционные условия для достижения 100% активности, производимых нами ферментов (эндонуклеаз рестриции). Каждый фермент поставляется в комплекте с рекомендованным 10хSE-буфером. Некоторые ферменты требуют специфические реакционные условия, поэтому для них созданы индивидуальные кратные SE-буферы. Также некоторым эндонуклеазам рестриции для достижения 100% активности дополнительно требуется бычий сывороточный альбумин (BSA) или S-аденозил-L-метионин (SAM). Когда это необходимо, данные реактивы поставляются в комплекте с ферментом и 10хSE-буфером. Состав: 1X(10 mM Tris-HCl (pH 8.5 при 25°C); 5 mM MgCl2; 1 mM DTT.) Условия хранения: Хранить при -20°C С ферментом поставляется: 10 Х SE-буфер.

Описание: X-Gal используется совместно с IPTG для определения lac-фенотипа при отборе белых/синих колоний E.coli. X-Gal представляет собой инертный хромогенный субстрат для β-галактозидазы – фермента, расщепляющего лактозу. β-галактозидаза гидролизует X-Gal с образованием бесцветной галактозы и 4-хлор-3-бром-индиго, который имеет синюю окраску. Индукция гена lacZ путем добавления IPTG приводит к расщеплению X-Gal и появлению синих колоний E.coli. В случае нарушения структуры гена lacZ за счет встройки генетического материала (или делеции) цвет колоний будет белым. Стоковый раствор X-Gal следует готовить в необходимом количестве непосредственно перед его добавлением в расплавленный LB-агар при его температуре 50-55 o C. В качестве растворителя для X-Gal используется диметилсульфоксид (DMSO). Рекомендуется приготовить стоковый раствор X-Gal в DMSO с концентрацией 40-100 мг/мл. Конечная концентрация X-Gal в среде LB может быть 40-100 мкг/мл (для получения белых/синих колоний E.coli). Вариант применения: На 100 мл расплавленного LB-агара (50-55 o C) взять: 100 мкл стокового раствора X-Gal (10 мг сухого X-Gal растворить в 100 мкл DMSO в отдельной стерильной микропробирке); 40 мкл 0,5 М водного раствора IPTG; необходимое количество антибиотика (например, ампициллина до 50 мкг/мл). Все тщательно перемешать, разлить по чашкам Петри. Подсушить в стерильном боксе под УФ в течение 20-30 мин.

Описание: Набор dNTP (ферментативно синтезированных) состоит из четырех индивидуальных растворов dATP, dCTP, dGTP, dTTP. Концентрация каждого dNTP 40 mM. Тестировано в ПЦР для получения продуктов длиной более 15 тыс. пар нуклеотидов с ДНК фага Т7 в качестве матрицы. . Способ получения: Ферментативный синтез Условия хранения: Хранить при -20°С Контроль качества: Тест на отсутствие примесей РНКаз: После инкубации смеси dNTP в течение 30 минут с флуоресцентно меченным олигонуклеотидом гидролиза не наблюдается. Тест на отсутствие примесей эндо- и экзодезоксирибонуклеаз и фосфатаз: После инкубации смеси dNTP в течение 3-х часов с одно- и двуцепочечными олигонуклеотидами гидролиза не наблюдается.

Сайт узнавания и позиция гидролиза: GACNNNGTC GACN↑NNGTC CTGNNNCAG CTGNN↓NCAG Источник: Из штамма E.coli несущего клонированный ген Tth111 I из Thermus Thermophilus 111 Определение единицы активности: За единицу активности принимается количество фермента, необходимое для гидролиза 1 мкг ДНК фага лямбда (HindIII-digest) за 1 час при 65°С в 50 мкл реакционной смеси. Субстрат для определения активности: ДНК фага лямбда (HindIII-digest) Оптимальный буфер: SE-буфер Y Активность фермента в различных буферах в процентах от максимальной: B G O W Y ROSE 75 50 10 10 100 100 Условия хранения: 10 mM Tris-HCl (pH 7.5); 500 mM NaCl; 0,1 mM EDTA; 1 mM DTT; 50% глицерин; Хранить при -20°С. Лигирование: После гидролиза 2-кратным избытком фермента 10% фрагментов ДНК сшиваются ДНК-лигазой. Неспецифический гидролиз: Картина специфического гидролиза не изменяется при обработке 1 мкг ДНК 5 ед фермента в течение 16 часов при 65°С. Чувствительность к метилированию: не проверялось С ферментом поставляется: 10 Х SE-буфер Y. Примечание: Большой избыток фермента приводит к появлению звездчатой активности.

Сайт узнавания и позиция гидролиза: AGCT AG↑CT TCGA TC↓GA Источник: Из штамма E.coli несущего клонированный ген Alu I изArthrobacter luteus Определение единицы активности: За единицу активности принимается количество фермента, необходимое для гидролиза 1 мкг ДНК фага лямбда за 1 час при 37°С в 50 мкл реакционной смеси. Субстрат для определения активности: ДНК фага лямбда Оптимальный буфер: SE-буфер Y Активность фермента в различных буферах в процентах от максимальной: B G O W Y ROSE 75 75 10 50 100 50 Условия хранения: 10 mM Tris-HCl (pH 7.5); 100 mM NaCl; 0.1 mM EDTA; 200 μg/ml BSA; 1 mM DTT, 50% глицерин; Хранить при -20°С. Лигирование: После гидролиза 5-кратным избытком фермента примерног 90% фрагментов ДНК сшиваются ДНК-лигазой и могут быть повторно расщеплены. Неспецифический гидролиз: Картина специфического гидролиза не изменяется при обработке 1 мкг ДНК 4 ед фермента в течение 16 часов при 37°С. Чувствительность к метилированию: не проверялось С ферментом поставляется: 10 Х SE-буфер Y. Для фасовок Turbo (E015T и E016T) прикладывается только буфер ROSE.

Сайт узнавания и позиция гидролиза: CCWWGG C↑CWWGG GGWWCC GGWWC↓C Источник: Erwinia rhapontici Определение единицы активности: За единицу активности принимается количество фермента, необходимое для гидролиза 1 мкг ДНК фага лямбда за 1 час при 37°С в 50 мкл реакционной смеси. Субстрат для определения активности: ДНК фага лямбда Оптимальный буфер: SE-буфер 2W Активность фермента в различных буферах в процентах от максимальной: B G O W Y ROSE 10 25 50 75 10 100 Условия хранения: 10 mM Tris-HCl (pH 7.5); 50 mM KCl; 0,1 mM EDTA; 200 ug/ml BSA; 7 mM 2-меркаптоэтанол; 50% глицерин; Хранить при -20°С. Лигирование: После гидролиза 20-кратным избытком фермента 95% фрагментов ДНК сшиваются ДНК-лигазой и могут быть повторно расщеплены. Неспецифический гидролиз: Картина специфического гидролиза не изменяется при обработке 1 мкг ДНК 40 ед фермента в течение 16 часов при 37°С. Чувствительность к метилированию: не проверялось С ферментом поставляется: 10 Х SE-буфер 2W, BSA. Примечание: Для достижения 100% активности BSA следует добавлять в реакционную смесь до концентрации 100 мкг/мл. BSA при длительной инкубации использовать не рекомендуется.

Источник: pHspAI2 выделена из штамма E.coli (dam+, dcm+) с использованием стандартной методики Описание: Субстрат pHspAI2/GsaI представляет собой ДНК плазмиды pHspAI2, линеаризованной эндонуклеазой рестрикции GsaI. Плазмида pHspAI2 содержит фрагмент геномной ДНК бактериального штамма Haemophilus species A1, включающий ген ДНК-метилтрансферазы M.HspAI, и единственный канонический сайт узнавания GlaI 5`-G(5mC)G(5mC)-3`/3`-(5mC)G(5mC)G-5`. Условия хранения: 10 mM Tris-HCl (pH 7.8); 1 mM EDTA. Хранить при – 20°С.