Биореактивы

MD ДНК эндонуклеаза Mte I. Метилзависимая ДНК эндонуклеаза отличается от эндонуклеаз рестрикции тем, что режет ДНК исключительно при наличии метильных групп в сайте узнавании. При отсутствии метилирования гидролиз отсутствует. Сайт узнавания и позиция гидролиза: G(5mC)G(5mC)NG(5mC)G(5mC) G(5mC)G(5mC)↑NG(5mC)G(5mC) (5mC)G(5mC)GN(5mC)G(5mC)G (5mC)G(5mC)GN↓(5mC)G(5mC)G Источник: Из штамма E.coli, несущего клонированный ген Mte I из Microbacterium testaceum 17B Определение единицы активности: За одну единицу активности принимается количество фермента, необходимое для полного гидролиза 1 мкг ДНК плазмиды pHspAI10/DriI дополнительно метилированной M.Fsp4HI за 1 час при 55°С в 50 мкл реакционной смеси Определение активности MteI В каждом случае проводилась инкубация фермента с 1 мкг ДНК pHspAI10/DriI/metM.Fsp4HI в 50 мкл реакционной смеси (см. Единица активности). После инкубации аликвота реакционной смеси 15 мкл наносилась на гель. Субстрат для определения активности: Субстрат pHspAI10/DriI/metM.Fsp4HI представляет собой ДНК плазмиды pHspAI10, линеаризованной эндонуклеазой рестрикции DriI и метилированной ДНК-метилтрансферазой Fsp4HI. Плазмида pHspAI10 содержит ген ДНК-метилтрасферазы M.HspAI, которая модифицирует сайт узнавания 5`-GCGC-3` с образованием 5`-G(5mC)GC-3`/3`-CG(5mC)G-5`. Кроме того, данная плазмида дополнительно метилирована ДНК-метилтрасферазой М.Fsp4HI, которая модифицирует сайт 5`-GCNGC-3` с образованием 5`-G(5mC)NGC-3`/3`-CGN(5mC)G-5`. В результате в используемом субстрате имеется один канонический сайт узнавания МteI: 5`-G(5mC)G(5mC)NG(5mC)G(5mC)-3`/3`-(5mC)G(5mC)GN(5mC)G(5mC)G-5`. МteI может также расщеплять сайт узнавания, включающий шесть 5-метилцитозинов [1], однако активность фермента в этом случае меньше более чем на порядок. Оптимальный буфер: SE-буфер W Активность фермента в различных буферах в процентах от максимальной: B G O W Y ROSE 25 75 75 100 50 100 Условия хранения: 10 mM Tris-HCl (pH 7.5); 200 mM NaCl; 0.1 mM EDTA; 7 mM 2-меркаптоэтанол; 200мкг/мл BSA, 50% глицерин. Хранить при -20°С. Лигирование: Неспецифический гидролиз: Не наблюдается неспецифического гидролиза при инкубации 40 ед фермента Mte I с 1 мкг ДНК фага лямбда в течение 16 часов при 55°С в 50 мкл реакционной смеси. Чувствительность к метилированию: Фермент расщепляет только С5-метилированную ДНК. С ферментом поставляется: 10 Х SE-буфер W, pHspAI10/DriI дополнительно метилированная M.Fsp4HI .

Источник: Выделена из культуры клеток человека линии Raji, мужских лимфобластоподобных клеток из лимфомы Беркитта. Описание: Геномная ДНК из культуры клеток человека линии Raji. Клетки выращивались в питательной среде RPMI-1640 – 90%, сыворотка крови плода коровы – 10%. Способ культивирования – суспензионный. Геномная ДНК выделялась по стандартной методике. Условия хранения: 10 mM Tris-HCl (pH 7.8); 1 mM EDTA. Хранить при – 20°С. Контроль качества: Препарат ДНК не содержит примесей белков и РНК. Примечание: Следует избегать многократного замораживания-оттаивания.

MD ДНК эндонуклеаза Aox I. Метилзависимая ДНК эндонуклеаза отличается от эндонуклеаз рестрикции тем, что режет ДНК исключительно при наличии метильных групп в сайте узнавании. При отсутствии метилирования гидролиз отсутствует. Сайт узнавания и позиция гидролиза: RG(5mC)Y ↑RG(5mC)Y RG(5mC)Y ↓RG(5mC)Y Источник: Arthrobacter oxydans 25K Определение единицы активности: За одну единицу активности принимается количество фермента, необходимое для полного гидролиза линейной формы 1 мкг плазмиды pMHaeIII/DriI за 1 час при 60°С в 50 мкл реакционной смеси. При этом происходит исчезновение исходной линейной формы плазмиды pMHaeIII/DriI (см. рисунок ниже, дор. 4). Субстрат для определения активности: Субстрат pMHaeIII/DriI представляет собой ДНК плазмиды pMHaeIII, линеаризованной эндонуклеазой рестрикции DriI. Плазмида pMHaeIII содержит ген ДНК-метилтрансферазы M.HaeIII из Haemophilus aegyptuus, которая модифицирует сайт узнавания 5` GGCC 3` с образованием 5` GG(5mC)C 3`/3` C(5mC)GG 5`. Оптимальный буфер: SE-буфер AoxI Активность фермента в различных буферах в процентах от максимальной: B G O W Y ROSE 75 25 10 25 75 100 Условия хранения: 10 mM Tris-HCl (pH 7.4); 100 mM NaCl; 0.1 mM EDTA; 7 mM 2-меркаптоэтанол; 50% глицерин. Хранить при -20°С. Лигирование: Неспецифический гидролиз: Не наблюдается неспецифического гидролиза при инкубации 1 ед фермента Aox I с 1 мкг ДНК фага лямбда в течение 16 часов при 60°С в 50 мкл реакционной смеси. Чувствительность к метилированию: Фермент расщепляет только метилированную ДНК. Не расщепляет немодифицированную ДНК . С ферментом поставляется: 10 Х SE-буфер AoxI.

Сайт узнавания и позиция гидролиза: AGCGCT AGC↑GCT TCGCGA TCG↓CGA Источник: Из штамма E.coli несущего клонированный ген Afe I из Alcaligenes faecalis T2774 Определение единицы активности: За единицу активности принимается количество фермента, необходимое для гидролиза 1 мкг ДНК фага лямбда (BamHI-digest) за 1 час при 37°С в 50 мкл реакционной смеси. Субстрат для определения активности: ДНК фага лямбда (BamHI-digest) Оптимальный буфер: SE-буфер Y Активность фермента в различных буферах в процентах от максимальной: B G O W Y ROSE 10 25 75 75 100 100 Условия хранения: 10 mM Tris-HCl (pH 7.6); 50 mM NaCl; 0.1 mM EDTA; 1 mM DTT; 200 ug/ml BSA; 50% глицерин; Хранить при -20°С. Лигирование: После гидролиза 10-кратным избытком фермента более 80% фрагментов ДНК pBR322 сшиваются ДНК-лигазой и могут быть повторно расщеплены. Неспецифический гидролиз: Картина специфического гидролиза не изменяется при обработке 1 мкг ДНК 20 ед фермента в течение 16 часов при 37°С. Чувствительность к метилированию: не проверялось С ферментом поставляется: 10 Х SE-буфер Y Для фасовок Turbo прикладывается 10 X SE-буфер ROSE.

Источник: Выделена из штамма E.coli, несущего клонированный ген ДНК Лигазы из фага Т4 Описание: Катализирует образование фосфодиэфирной связи между 5`-фосфатной и 3`-гидроксильными концевыми группами ДНК (РНК). Определение единицы активности: За одну единицу активности Т4 ДНК лигазы принимали количество фермента, необходимое для 50% сшивки HindIII-фрагментов ДНК фага лямбда за 30 мин при 16°С в 20 мкл реакционной смеси при концентрации ДНК 300 mkg/ml. Оптимальный буфер: SE-буфер ДНК лигаза T4 Условия хранения: 10 mM Tris-HCl (pH 7.5); 50 mM NaCl; 0,1 mM EDTA; 7 mM 2-меркаптоэтанол; 50% глицерин. Хранить при -20°C. Примечание: В буфере для Т4 ДНК лигазы допускается выпадение осадка. В этом случае необходимо перед использованием нагреть буфер до 37°С и встряхнуть его несколько раз до исчезновения осадка.Кроме того, стоит избегать многократного замораживания/оттаивания буфера.Поэтому после первой разморозки рекомендуется расфасовать буфер небольшими объемами в отдельные пробирки, хранить при -20°C, и не размораживать аликвоты более 2-3 раз. Допускается хранение размороженного буфера при +4 °С в течение 7 дней. см. новый Набор для быстрой сшивки ДНК.

Сайт узнавания и позиция гидролиза: CCTAGG C↑CTAGG GGATCC GGATC↓C Источник: Arthrobacter species A2 Определение единицы активности: За единицу активности принимается количество фермента, необходимое для гидролиза 1 мкг ДНК фага лямбда (HindIII-digest) за 1 час при 37°С в 50 мкл реакционной смеси. Субстрат для определения активности: ДНК фага лямбда (HindIII-digest) Оптимальный буфер: SE-буфер W Активность фермента в различных буферах в процентах от максимальной: B G O W Y ROSE 10 50 75 100 75 10 Условия хранения: 10 mM Tris-HCl (pH 7.5); 100 mM NaCl; 0.1 mM EDTA; 7 mM 2-меркаптоэтанол; 100 ug/ml BSA, 50% глицерин. Хранить при -20°C. Лигирование: После гидролиза 10-кратным избытком фермента более 90% фрагментов ДНК сшиваются ДНК-лигазой и могут быть повторно расщеплены. Неспецифический гидролиз: Картина специфического гидролиза не изменяется при обработке 1 мкг ДНК 20 ед фермента в течение 16 часов при 37°C. Чувствительность к метилированию: не проверялось С ферментом поставляется: 10 Х SE-буфер W, BSA. Для фасовок Turbo прикладывается 10 X SE-буфер W+. Примечание: Для достижения 100% активности BSA следует добавлять в реакционную смесь до концентрации 100 мкг/мл. BSA при длительной инкубации использовать не рекомендуется.

Сайт узнавания и позиция гидролиза: GACGTC GACGT↑C CTGCAG C↓TGCAG Источник: Из штамма E.coli несущего клонированный ген Aat II из Acetobacter aceti Определение единицы активности: За единицу активности принимается количество фермента, необходимое для гидролиза 1 мкг ДНК фага лямбда за 1 час при 37°C в 50 мкл реакционной смеси. Субстрат для определения активности: ДНК фага лямбда Оптимальный буфер: SE-буфер Y Активность фермента в различных буферах в процентах от максимальной: B G O W Y ROSE 10 25 10 25 100 50 Условия хранения: 10 mM Tris-HCl (pH 7.5); 50 mM NaCl; 0.1 mM EDTA; 200 ug/ml BSA; 1 mM DTT; 50% глицерин; Хранить при -20°C Лигирование: После гидролиза 10-кратным избытком фермента более 90% фрагментов ДНК сшиваются ДНК-лигазой и могут быть повторно расщеплены. Неспецифический гидролиз: Картина специфического гидролиза не изменяется при обработке 1 мкг ДНК 10 ед фермента в течение 16 часов при 37°C. Чувствительность к метилированию: не проверялось С ферментом поставляется: 10 Х SE-буфер Y Для фасовок Turbo прикладывается 10 X SE-буфер ROSE. Примечание: Большой избыток фермента приводит к появлению звездчатой активности.

Описание: Мы предлагаем 10хSE-буферы, оптимизированные для работы с нашими ферментами. 10хSE-буферы обеспечивают оптимальные реакционные условия для достижения 100% активности, производимых нами ферментов (эндонуклеаз рестриции). Каждый фермент поставляется в комплекте с рекомендованным 10хSE-буфером. Некоторые ферменты требуют специфические реакционные условия, поэтому для них созданы индивидуальные кратные SE-буферы. Также некоторым эндонуклеазам рестриции для достижения 100% активности дополнительно требуется бычий сывороточный альбумин (BSA) или S-аденозил-L-метионин (SAM). Когда это необходимо, данные реактивы поставляются в комплекте с ферментом и 10хSE-буфером. Состав: 1X(10 mM Tris-HCl (pH 7.6 при 25°C); 10 mM MgCl2; 50 mM NaCl, 1 mM DTT.) Условия хранения: Хранить при -20°C. Допускается хранение буфера при 4-10°C в течение 3 месяцев. С ферментом поставляется: 10 Х SE-буфер.

Сайт узнавания и позиция гидролиза: GATC ↑GATC CTAG CTAG↓ Источник: Kurthia zopfii 9 Определение единицы активности: За единицу активности принимается количество фермента, необходимое для гидролиза 1 мкг ДНК фага лямбда за 1 час при 37°С в 50 мкл реакционной смеси. Субстрат для определения активности: ДНК фага лямбда Оптимальный буфер: SE-буфер G Активность фермента в различных буферах в процентах от максимальной: B G O W Y ROSE 50 100 50 50 50 100 Условия хранения: 10 mM Tris-HCl (pH 7.5); 50 mM KCl; 0,1 mM EDTA; 200 ug/ml BSA; 7 mM 2-меркаптоэтанол; 50% глицерин; Хранить при -20°С. Лигирование: После гидролиза 3-кратным избытком фермента более 95% фрагментов ДНК сшиваются ДНК-лигазой и могут быть повторно расщеплены. Неспецифический гидролиз: Картина специфического гидролиза не изменяется при обработке 1 мкг ДНК 6 ед фермента в течение 16 часов при 37°С. Чувствительность к метилированию: Не блокируется при перекрывании Dam-метилированием (GmATC): GATC. При перекрывании CG метилированием гидролиз затруднен: GATmCG. Блокируется при перекрывании CG метилированием: CGATmCGС ферментом поставляется: 10 Х SE-буфер G.

Геномная ДНК из культуры клеток человека линии HeLa, гидролизованная эндонуклеазой рестрикции TaqI (5’-T^CGA-3’), эндонуклеазой рестрикции AgsI (5’-TTS^AA-3’) или эндонуклеазой рестрикции HaeIII (5’-GG^CC-3’) и метилированная метилтрансферазой M.SssI. Содержит метилированные сайты 5’-(5mC)G-3’. Уровень метилирования гидролизатов ДНК HeLa более 97%. Поставляется в буфере хранения (10 mM Tris-HCl, pH 8.0, 1 mM EDTA).

Источник: Выделена из рекомбинантного штамма E.coli экспрессирующего ген ДНК-полимеразы из Thermus aquaticus YT1 Описание: Hot Start Taq ДНК-полимераза является сложной смесью термостабильной Taq ДНК-полимеразы молекулярной массой 94 kDa и специфических моноклональных антител из мыши. Hot Start Taq неактивна в условиях приготовления реакции амплификации. Это позволяет исключать такие артефакты амплификации как образование димеров праймеров и ошибочное праймирование на протяжении стадии преамплификации и таким образом может улучшать специфичность по сравнению со стандартными ДНК полимеразами. Преимуществом Hot Start Taq является отсутствие дополнительного нагрева для активации полимеразы. Тепловая активация фермента происходит в течение первой денатурации. Неактивный комплекс Hot Start Taq диссоциирует автоматически при повышении температуры выше + 70 °C, приводя к активации ДНК-полимеразы. Катализирует матричный синтез ДНК путем переноса нуклеотида от dNTP на 3`конец ДНК. Применение: Высокоспецифичная PCR Мультиплексная PCR (особенно рекомендуется) Высокочувствительные применения Определение единицы активности: За одну единицу активности принимается количество фермента требуемое для включения 10 нмолей dNTP в кислотонерастворимую фракцию за 30 минут при 74 °C Оптимальный буфер: SE-буфер ДНК полимераза Hot Start Taq Условия хранения: 20 mM Tris-HCl (pH 8.0); 100 mM KCl, 0.1 mM EDTA, 1 mM DTT, 50 % глицерин; 0.5 % Nonidet P-40, 0.5 % Tween-20. Хранить при -20°С. С ферментом поставляется: 10 x SE-буфер Hot Start Taq ДНК полимераза, MgCl2.

Сайт узнавания и позиция гидролиза: GRCGYC GR↑CGYC CYGCRG CYGC↓RG Источник: Bacillus stearothermophilus AC Определение единицы активности: За единицу активности принимается количество фермента, необходимое для гидролиза 1 мкг ДНК фага лямбда за 1 час при 37°С в 50 мкл реакционной смеси. Субстрат для определения активности: ДНК фага лямбда Оптимальный буфер: SE-буфер W Активность фермента в различных буферах в процентах от максимальной: B G O W Y ROSE 75 75 50 100 75 100 Условия хранения: 10 mM Tris-HCl (pH 7.5); 200 mM KCl; 0.1 mM EDTA; 7 mM 2-меркаптоэтанол; 200 ug/ml BSA; 50% глицерин. Хранить при -20°C. Лигирование: После гидролиза 10-кратным избытком фермента более 90% фрагментов ДНК сшиваются ДНК-лигазой и могут быть повторно расщеплены. Неспецифический гидролиз: Картина специфического гидролиза не изменяется при обработке 1 мкг ДНК 20 ед фермента в течение 16 часов при 37°C. Чувствительность к метилированию: не проверялось С ферментом поставляется: 10 Х SE-буфер W. Для фасовок Turbo прикладывается 10 X SE-буфер ROSE.