Биореактивы

Сайт узнавания и позиция гидролиза: GCTCTTCN GCTCTTCN↑ CGAGAAG(N)4 CGAGAAG(N)4↓ Источник: Planococcus citreus S Определение единицы активности: За единицу активности принимается количество фермента, необходимое для гидролиза 1 мкг ДНК фага лямбда за 1 час при 37°С в 50 мкл реакционной смеси. Субстрат для определения активности: ДНК фага лямбда Оптимальный буфер: SE-буфер B Активность фермента в различных буферах в процентах от максимальной: B G O W Y ROSE 100 50 75 50 Условия хранения: 10 mM Tris-HCl (pH 7.5); 50 mM KCl; 0,1 mM EDTA; 200 ug/ml BSA; 7 mM 2-меркаптоэтанол; 50% глицерин. Хранить при -20°С. Лигирование: После гидролиза 3-кратным избытком фермента около 90% фрагментов ДНК сшиваются Т4 ДНК-лигазой и около 95% из них могут быть повторно расщеплены Неспецифический гидролиз: Картина специфического гидролиза не изменяется при обработке 1 мкг ДНК 0.5 ед фермента в течение 16 часов при 37°С Чувствительность к метилированию: не проверялось С ферментом поставляется: 10 Х SE-буфер B.

Талидомид-содержащий билдинг-блок с PEG2-линкером и азидной группой для конъюгации с алкин-функционализированными линкерами и лигандами целевых белков посредством клик-химических реакций. Комбинированные молекулы выборочного протеолиза белка (PROteolysis TArgeting Chimeras, PROTACs) — это гетеробифункциональные молекулы, способные проникать через клеточную мембрану, и позволяющие удалять выбранный целевой белок из клетки. Один конец молекулы PROTAC содержит лиганд, способный связываться с белком интереса, а второй — с субтрат-распознающим белком белкового комплекса E3-лигазы. Сближение белка и E3-лигазы вызывает полиубиквитинирование субстрата с последующей его деградацией клеточной протеасомой, которая распознает убиквитиновую метку. Существует несколько Е3-лигазных комплексов, которые на практике подходят для PROTAC. Талидомид — лиганд, который позволяет мобилизовать цереблон E3-лигазу (CRBN). Его используют многие новые исследовательские препараты работающие по механизму PROTAC, находящиеся на последних стадиях клинических испытаний.

10X SNPdetect буфер не содержит ионы магния. Для оптимизации концентрации ионов магния в реакционной смеси используйте 50 мМ раствор MgCl2. При концентрации 2.5 мМ, как правило, достигается наиболее эффективная дискриминация аллелей. Поскольку магний является кофактором полимеразы, увеличение концентрации ионов Mg2+ увеличивает выход реакции. Однако, одновременно снижается её специфичность и растет неспецифическая (фоновая) амплификация. В связи с тем, что ионы магния являются кофактором полимеразы, увеличение концентрации ионов Mg2+ увеличивает выход реакции, одновременно понижая ее специфичность и повышая фоновую амплификацию.

Набор предназначен для предварительной обработки биологического материала человека и бактериальных культур с помощью лизоцима перед процедурой выделения ДНК с целью увеличения выхода бактериальной ДНК и снижения концентрации ингибиторов. Один набор рассчитан на обработку 50 образцов. Набор выпускается в полностью готовой к использованию и лиофилизированной формах. В комплект лиофилизированного набора входит буфер для разведения лизоцима. Перед началом работы необходимо 20 мг лиофилизированного лизоцима растворить в 200 мкл буфера для растворения лизоцима.

Сайт узнавания и позиция гидролиза: CCNGG CC↑NGG GGNCC GGN↓CC Источник: Micrococcus species R9 Определение единицы активности: За единицу активности принимается количество фермента, необходимое для гидролиза 1 мкг ДНК фага лямбда (dcm-) за 1 час при 37°С в 50 мкл реакционной смеси. Субстрат для определения активности: ДНК фага лямбда (dcm-) Оптимальный буфер: SE-буфер O Активность фермента в различных буферах в процентах от максимальной: B G O W Y ROSE 50 50 100 50 50 100 Условия хранения: 10 mM Tris-HCl (pH 7.5); 100 mM NaCl; 0,1 mM EDTA; 100 ug/ml BSA; 7 mM2-меркаптоэтанол; 50% глицерин; Хранить при -20°С. Лигирование: После гидролиза 2-кратным избытком фермента <5% фрагментов ДНК сшиваются и могут быть повторно расщеплены. Неспецифический гидролиз: Картина специфического гидролиза не изменяется при обработке 1 мкг ДНК 40 ед фермента в течение 16 часов при 37°С. Чувствительность к метилированию: Блокируется при перекрывании dcm-метилированием (CmCWGG): CCWGG. С ферментом поставляется: 10 Х SE-буфер O.

BCN-PNP представляет собой инструмент для введения фрагмента BCN через взаимодействие с первичными аминогруппами субстрата. Реакция аналогична взаимодействию NHS-эфиров с аминами, но пара-нитрофениловый эфир обеспечивает меньший нецелевой гидролиз и более высокий выход при конъюгации, образуя гидролитически стабильную карбаматную связь с субстратом. Бициклононин (BCN) является одним из наиболее реакционноспособных циклооктинов для безмедной клик химии. И экзо-, и эндо-изомеры BCN активны и имеют близкие константы скорости реакций в пределах одного порядка [1,2]. BCN реагирует быстрее с ароматическими азидами, чем ДБЦО [1] и, по сравнению с аннелированными системами, имеет два преимущества. Первое, это особенность плоскостной симметрии, что позволяет предотвратить образование смесей стереоизомерных продуктов при конъюгации. Bторое, BCN обеспечивает более низкую липофильность коньюгатов, что обычно предпочтительно при работе в водных системах. В отличие от ДБЦО, реакционная способность BCN не ограничивается азидами (SPAAC) и нитронами (SPANC), но также охватывает тетразины (IEDDA) [2] и, по последним данным, тетразолы (фотоклик) [3], обеспечивая исключительную высокую скорость реакции присоединения.

Олигоэтиленгликоли - гидрофильные линкеры, находящие применение в биоконъюгации. Данная бифункциональная молекула на основе короткого линкера диэтиленгликоля (ПЭГ2) содержит аминогруппу, которую можно модифицировать путем ацилирования (ангидридами и активированными эфирами), восстановительного аминирования (реакции с альдегидами и кетонами в присутствии восстановителя), алкилирования (эпоксидами, галогенидами), а также с помощью других реакций. Другая функциональная группа - алкиновая - вступает в медь-катализируемую реакцию диполярного циклоприсоединения с азидами (CuAAC) и палладий-катализируемую реакцию Соногаширы с арил- и винилгалогенидами и трифлатами.

BDP 650/665 — яркий флуорофор, обладающий эмиссией в красной области спектра (канал Cyanine5 или Cy5). Этот краситель характеризуется высоким мольным коэффициентом экстинкции и хорошим квантовым выходом флуоресценции. Он умеренно гидрофобный, но позволяет проводить мечение биомолекул в водной среде. Поэтому этот флуорофор представляет собой хорошую альтернативу красителю Cy5. Малеимидная группа предназначена для осуществления конъюгации с тиолами. Данное соединение можно использовать для мечения цистеиновых остатков в белках и пептидах, а также для модификации других соединений, имеющих SH-группу.

Аминопроизводное красителя Cyanine5.5 (аналога Cy5.5®). Краситель содержит свободную аминогруппу, которую можно конъюгировать с различными электрофилами - например с активированными эфирами, эпоксидами. Cyanine5.5 - краситель для дальнекрасной области, который подходит как для неинвазивного имэджинга в тканях, так и для применений, требующих низкого фонового уровня флуоресценции.

Источник: Выделена из штамма E.coli, несущего рекомбинантный ген Taq-ДНК-полимеразы из Thermus aquaticus.. Описание: Катализирует матричный синтез ДНК путем переноса нуклеотида от dNTP на 3` конец ДНК Определение единицы активности: За одну единицу активности Taq ДНК полимеразы принимали количество фермента,необходимое для включения 10 нмолей dNTP в кислотонерастворимую фракцию за 30 мин при 72°С. Оптимальный буфер: SE-буфер ДНК полимераза Taq Условия хранения: 20 mM Tris-HCl (pH 7.6); 100 mM KCl; 0.1 mM EDTA; 1 mM DTT; 0,5 % Тритон Х-100; 50% глицерин. Хранить при -20°С

Тест-система предназначена для выявления ДНК кролика в биологическом материале (кровь, сыворотка, ткани и др.), пищевых продуктах (колбасы, сосиски, сардельки, фарши и т.д.) и кормах для животных методом ПЦР c детекцией результатов в режиме «реального времени» (ПЦР-РВ).

Сайт узнавания и позиция гидролиза: CCTCGAGG CC↑TCGAGG GGAGCTCC GGAGCT↓CC Источник: Из штамма E.coli несущего клонированный ген Abs Iиз Arthrobacter species 7М06. Определение единицы активности: За единицу активности принимается количество фермента, способное гидролизовать 1 мкг ДНК pUC19SE/DriI в 50 мкл реакционной смеси в SE-буфере AbsI при 37°С за 1 час Субстрат для определения активности: pUC19SE/DriI Оптимальный буфер: SE-буфер AbsI Активность фермента в различных буферах в процентах от максимальной: B G O W Y ROSE 10-25 10-25 0-10 25-50 10-25 25 Условия хранения: 10 mM Tris-HCl (pH 7.5), 50 mM KCl, 0.1 mM EDTA, 200 мкг/мл BSA, 0.05% Triton X-100, 7 mM 2-меркаптоэтанол, 50% глицерин. Хранить при -20°С. Лигирование: После гидролиза 5-кратным избытком фермента около 90% фрагментов ДНК сшиваются ДНК-лигазой и могут быть повторно расщеплены. Неспецифический гидролиз: Картина специфического гидролиза не изменяется при обработке 1 мкг ДНК 10 ед фермента в течение 16 часов при 37°С. Чувствительность к метилированию: не проверялось С ферментом поставляется: 10 Х SE-буфер AbsI Примечание: Длительная инкубация может привести к появлению звездчатой активности.