Биореактивы

Сайт узнавания и позиция гидролиза: ACTGGN ACTGGN↑ TGACCN TGAC↓CN Источник: Bacillus stearothermophilus 1 Определение единицы активности: За единицу активности принимается количество фермента, необходимое для гидролиза 1 мкг ДНК фага лямбда за 1 час при 65°С в 50 мкл реакционной смеси. Субстрат для определения активности: ДНК фага лямбда Оптимальный буфер: SE-буфер Y Активность фермента в различных буферах в процентах от максимальной: B G O W Y ROSE 75 75 25 10 100 100 Условия хранения: 10 mM Tris-HCl (pH 7.5); 100 mM NaCl; 0.1 mM EDTA; 7 mM 2-меркаптоэтанол; 100 ug/ml BSA; 50% глицерин; Хранить при -20°C. Лигирование: После гидролиза 20-кратным избытком фермента более 95% фрагментов ДНК сшиваются ДНК-лигазой и могут быть повторно расщеплены. Неспецифический гидролиз: Картина специфического гидролиза не изменяется при обработке 1 мкг ДНК 40 ед фермента в течение 16 часов при 65°C. Чувствительность к метилированию: не проверялось С ферментом поставляется: 10 Х SE-буфер Y.

Описание: Мы предлагаем 10хSE-буферы, оптимизированные для работы с нашими ферментами. 10хSE-буферы обеспечивают оптимальные реакционные условия для достижения 100% активности, производимых нами ферментов (эндонуклеаз рестриции). Каждый фермент поставляется в комплекте с рекомендованным 10хSE-буфером. Некоторые ферменты требуют специфические реакционные условия, поэтому для них созданы индивидуальные кратные SE-буферы. Также некоторым эндонуклеазам рестриции для достижения 100% активности дополнительно требуется бычий сывороточный альбумин (BSA) или S-аденозил-L-метионин (SAM). Когда это необходимо, данные реактивы поставляются в комплекте с ферментом и 10хSE-буфером. Состав: 1X(20 mM Tris-HCl (pH 9.0 при 25°C); 10 mM MgCl2; 150 mM NaCl; 1 mM DTT.) Условия хранения: Хранить при -20°C С ферментом поставляется: 10 Х SE-буфер.

Источник: Из штамма E.coli, несущего рекомбинантный ген Описание: Экзонуклеаза III E.coli катализирует ступенчатое удаление мононуклеотидов с 3’-гидроксильного конца каждой из цепей двуцепочечной ДНК (работает в направлении 3’—>5’), если у этой ДНК «тупые» или 5’-выступающие концы. Экзонуклеаза III способна использовать в качестве субстрата и ДНК с 3’-выступающими концами, но только в случае, если длина такого выступающего конца менее 4-х нуклеотидов. Фермент также обладает эндонуклеазной активностью по отношению к апуринизированной ДНК, гидролизует РНК в РНК-ДНК-гибридах и обладает 3′-фосфатазной активностью. Определение единицы активности: За одну единицу активности принимали количество фермента, необходимого для образования 1 нмоля кислоторастворимых продуктов гидролиза за 30 мин при 37°С. Оптимальный буфер: SE-буфер Экзонуклеаза III Условия хранения: 10 mM Tris-HCl (pH 7.5); 50 mM KCl; 0.5 mM EDTA; 1 mM 2-меркаптоэтанол; 50% глицерин. Хранить при -20°С.

Сайт узнавания и позиция гидролиза: GCGATCGC GCGAT↑CGC CGCTAGCG CGC↓TAGCG Источник: Из штамма E.coli несущего клонированный ген AsiSI из Arthrobacter species S Определение единицы активности: За единицу активности принимается количество фермента, необходимое для гидролиза 1 мкг ДНК Аденовируса-2 за 1 час при 37°С в 50 мкл реакционной смеси. Субстрат для определения активности: ДНК Аденовируса-2 Оптимальный буфер: SE-буфер B Активность фермента в различных буферах в процентах от максимальной: B G O W Y ROSE 100 75 10 25 25 Условия хранения: 20 mM Tris-HCl (pH 7.5); 100 mM NaCl; 0.1 mM EDTA; 1 mM DTT; 200 μg/ml BSA; 50% глицерин; Хранить при -20°С. Лигирование: После гидролиза 5-кратным избытком фермента более 90% фрагментов ДНК сшиваются ДНК-лигазой и могут быть повторно расщеплены. Неспецифический гидролиз: Картина специфического гидролиза не изменяется при обработке 1 мкг ДНК 5 ед фермента в течение 16 часов при 37°С. Чувствительность к метилированию: Не блокируется dam-метилированием при перекрывании (GmATC): GCGATCGC Блокируется CG метилированием. С ферментом поставляется: 10 Х SE-буфер B. Примечание: Фермент обладает звездчатой активностью.

Сайт узнавания и позиция гидролиза: RGCGCY RGCGC↑Y YCGCGR Y↓CGCGR Источник: Bacillus stearothermophilus H2 Определение единицы активности: За единицу активности принимается количество фермента, необходимое для гидролиза 1 мкг ДНК фага лямбда за 1 час при 65°С в 50 мкл реакционной смеси. Субстрат для определения активности: ДНК фага лямбда Оптимальный буфер: SE-буфер Y + BSA Активность фермента в различных буферах в процентах от максимальной: B G O W Y ROSE 50 50 10 100 100 Условия хранения: 10 mM KH2PO4(pH 7.5); 10 mM NaCl; 0.1 mM EDTA; 7 mM 2-меркаптоэтанол; 200 ug/ml BSA; 50% глицерин. Хранить при -20°C. Лигирование: После гидролиза 10-кратным избытком фермента более 90% фрагментов ДНК сшиваются ДНК-лигазой и могут быть повторно расщеплены. Неспецифический гидролиз: Картина специфического гидролиза не изменяется при обработке 1 мкг ДНК 20 ед фермента в течение 16 часов при 65°C. Чувствительность к метилированию: не проверялось С ферментом поставляется: 10 Х SE-буфер Y, BSA Примечание: Большой избыток фермента приводит к появлению звездчатой активности. Для достижения 100% активности BSA следует добавлять в реакционную смесь до концентрации 100 мкг/мл. BSA при длительной инкубации использовать не рекомендуется.

Сайт узнавания и позиция гидролиза: GCTAGC GCTAG↑C CGATCG C↓GATCG Источник: Из штамма E.coli несущего клонированный ген Bmt I из Bacillus megaterium S2 Определение единицы активности: За единицу активности принимается количество фермента, необходимое для гидролиза 1 мкг ДНК фага лямбда (HindIII-digest) за 1 час при 37°С в 50 мкл реакционной смеси. Субстрат для определения активности: ДНК фага лямбда (Hind III-digest) Оптимальный буфер: SE-буфер W Активность фермента в различных буферах в процентах от максимальной: B G O W Y ROSE 10 50 50 100 75 100 Условия хранения: 10 mM Tris-HCl (pH 7.5); 200 mM NaCl; 0.1 mM EDTA; 1 mM DTT; 200 ug/ml BSA; 50% глицерин. Хранить при -20°С. Лигирование: После гидролиза 20-кратным избытком фермента более 90% фрагментов ДНК сшиваются ДНК-лигазой и могут быть повторно расщеплены. Неспецифический гидролиз: Картина специфического гидролиза не изменяется при обработке 1 мкг ДНК 20 ед фермента в течение 16 часов при 37°С. Чувствительность к метилированию: не проверялось С ферментом поставляется: 10 Х SE-буфер W. Для фасовок Turbo прикладывается 10 X SE-буфер ROSE.

Описание: Смесь дезоксинуклеозидтрифосфатов(ферментативно синтезированных) для ПЦР по 4mМ каждого. Тестирована в ПЦР при амплификации фрагмента ДНК фага Т7 длиной 15 тыс. пар нуклеотидов. Способ получения: Ферментативный синтез Условия хранения: Хранить при -20°С Контроль качества: Тест на отсутствие примесей РНКаз: После инкубации смеси dNTP в течение 30 минут с флуоресцентно меченным олигонуклеотидом гидролиза не наблюдается. Тест на отсутствие примесей эндо- и экзодезоксирибонуклеаз и фосфатаз: После инкубации смеси dNTP в течение 3-х часов с одно- и двуцепочечными олигонуклеотидами гидролиза не наблюдается.

Сайт узнавания и позиция гидролиза: ASST ASST↑ TSSA ↓TSSA Источник: Из штамма E.coli несущего клонированный ген SetI из Streptomyces werraensis 37 Определение единицы активности: За единицу активности принимается количество фермента необходимое для гидролиза 1 pmol олигонуклеотидного дуплекса указанной структуры за 1 час при 55°С в 20 μl реакционной смеси Субстрат для определения активности: Олигонуклеотидный дуплекс 5`-CGAGTTTATAGCTGGGCCCAAC-3` 3`-GCTCAAATATCGACCCGGGTTG-5` Оптимальный буфер: SE-буфер Y Активность фермента в различных буферах в процентах от максимальной: B G O W Y ROSE 25 25 75 75 100 100 Условия хранения: 10 mM Tris-HCl (pH 7.6); 100 mM NaCl; 0.1 mM EDTA; 1 mM DTT; 50% глицерин; Хранить при -20°С. Лигирование: После гидролиза 5-кратным избытком фермента около 50% фрагментов pBR322 ДНК сшиваются Т4 ДНК-лигазой и могут быть повторно расщеплены. Неспецифический гидролиз: Чувствительность к метилированию: не проверялось С ферментом поставляется: 10 Х SE-буфер Y.

MD ДНК эндонуклеаза Kro I. Метилзависимая ДНК эндонуклеаза отличается от эндонуклеаз рестрикции тем, что режет ДНК исключительно при наличии метильных групп в сайте узнавании. При отсутствии метилирования гидролиз отсутствует. Сайт узнавания и позиция гидролиза: GC(5mC)GGC G↑C(5mC)GGC CGG(5mC)CG CGG(5mC)C↓G Источник: Kocurea rosea 307 Определение единицы активности: За одну единицу активности принимается количество фермента, необходимое дляполного гидролиза 1 мкг линейной формы плазмиды pMHpaII1/DriI за 1 час при 37°С в 50 мкл реакционной смеси. Субстрат для определения активности: Субстрат pMHpaII1/DriI представляет собой ДНК плазмиды pMHpaII1, линеаризованной эндонуклеазой рестрикции DriI. Плазмида pMHpaII1 содержит ген ДНК-метилтрасферазы M.HpaII, которая модифицирует сайт узнавания 5`-CCGG-3` с образованием 5`-C(5mC)GG-3`/3`-GG(5mC)C-5`, и три сайта узнавания KroI 5`-GC(5mC)GGC-3`/3`-CGG(5mC)CG-5`. Оптимальный буфер: SE-буфер G Активность фермента в различных буферах в процентах от максимальной: B G O W Y ROSE 50 100 25 50 75 100 Условия хранения: 10 mM Tris-HCl (pH 7.5); 200 mM NaCl; 0.1 mM EDTA; 7 mM 2-меркаптоэтанол; 50% глицерин, 200 мкг/мл BSA. Хранить при -20°С. Лигирование: Неспецифический гидролиз: Не наблюдается неспецифического гидролиза при инкубации 1 ед фермента Kro I с 1 мкг ДНК фага лямбда в течение 16 часов при 37°С в 50 мкл реакционной смеси. Чувствительность к метилированию: Фермент расщепляет только С5-метилированную ДНК. Не расщепляет немодифицированную ДНК и ДНК, метилированную MspI ДНК-метилтрансферазой. С ферментом поставляется: 10 Х SE-буфер G.

Сайт узнавания и позиция гидролиза: GTTAAC GTT↑AAC CAATTG CAA↓TTG Источник: Из штамма E.coli несущего клонированный ген Hpa I из Haemophilus parainfluenzae Определение единицы активности: За единицу активности принимается количество фермента, необходимое для гидролиза 1 мкг ДНК фага лямбда за 1 час при 37°С в 50 мкл реакционной смеси. Субстрат для определения активности: ДНК фага лямбда Оптимальный буфер: SE-буфер Y Активность фермента в различных буферах в процентах от максимальной: B G O W Y ROSE 50 10 25 100 25 Условия хранения: 10 mM Tris-HCl (pH 7.5); 50 mM NaCl; 0.1 mM EDTA; 1 mM DTT; 200 μg/ml BSA; 50% глицерин. Хранить при -20°С. Лигирование: После гидролиза 5-кратным избытком фермента около 60% фрагментов ДНК сшиваются ДНК-лигазой и могут быть повторно расщеплены. Неспецифический гидролиз: Картина специфического гидролиза не изменяется при обработке 1 мкг ДНК 5 ед фермента в течение 16 часов при 37°С. Чувствительность к метилированию: не проверялось С ферментом поставляется: 10 Х SE-буфер Y. Для фасовок Turbo (E077T и E078T) прикладывается буфер Y. Примечание: Большой избыток фермента приводит к появлению звездчатой активности.

Сайт узнавания и позиция гидролиза: ACNGT ACN↑GT TGNCA TG↓NCA Источник: Bacillus stearothermophilus 4C Определение единицы активности: За единицу активности принимается количество фермента, необходимое для гидролиза 1 мкг ДНК фага лямбда за 1 час при 65°С в 50 мкл реакционной смеси. Субстрат для определения активности: ДНК фага лямбда Оптимальный буфер: SE-буфер Y Активность фермента в различных буферах в процентах от максимальной: B G O W Y ROSE 75 75 10 25 100 50 Условия хранения: 10 mM Tris-HCl (pH 7.5); 200 mM NaCl; 0.1 mM EDTA; 7 mM 2-меркаптоэтанол; 200 ug/ml BSA; 50% глицерин. Хранить при -20°C. Лигирование: После гидролиза 10-кратным избытком фермента ~50% фрагментов ДНК сшиваются ДНК-лигазой. Неспецифический гидролиз: Картина специфического гидролиза не изменяется при обработке 1 мкг ДНК 20 ед фермента в течение 16 часов при 65°C. Чувствительность к метилированию: не проверялось С ферментом поставляется: 10 Х SE-буфер Y

Сайт узнавания: GGAT(4mC)C Источник: из штамма E.coli, содержащего клонированный ген ДНК метилтрансферазы BamHI из Bacillus amyloliquefaciens H. Описание: Модифицирует внутренний цитозин (N4) в последовательности узнавания 5’-GGATCC- 3’. Определение единицы активности: За одну единицу активности принимают количество фермента, необходимое для защиты 1 мкг ДНК фага Лямбда за 1 час при 37°C в 20 мкл реакционной смеси от гидролиза эндонуклеазой рестрикции BamHI. Реакционный буфер: SE-буфер B + SAM Условия хранения: 10 mМ Tris-HCl (pH 7.4), 50 mМ NaCl, 0.1 mМ EDTA, 1 mМ DTT, 50% глицерин. Хранить при -20°С. Примечание: Для достижения 100% активности SAM следует добавлять в реакционную смесь до концентрации 80 μM.