Набор QuDye для определения количества одноцепочечной ДНК

ExoGen представляет собой готовую для использования смесь ферментов Genta-ExoI экзонуклеазы I и термолабильной щелочной фосфатазы Genta-ALP в реакционном буфере. Смесь ExoGen применяется для ферментативного гидролиза избыточного количества праймеров и нуклеотидов в продуктах ПЦР (ампликонах). Очищенные таким образом ПЦР-продукты пригодны для дальнейшего использования в различных биологических приложениях, таких как клонирование и ДНК-секвенирование.

5-кратный реакционный буфер, не содержащий сульфат магния.

5х Genta ТЕ-буфер для разведения нуклеиновых кислот. Состав: 10 мМ Трис*НCl, 1 мМ ЭДТА, pH 8,0. Приготовлен на сверхчистой воде.

Данный набор предназначен для измерения концентрации двухцепочечной ДНК в широком диапазоне на флуориметре (подходит любая версия флуориметра). Набор включает в себя 200× концентрат флуоресцентного красителя QuDye dsDNA BR, буфер для приготовления рабочего раствора красителя и стандарты концентрации ДНК (0 и 100 нг/мкл). Краситель QuDye dsDNA BR обладает селективностью по отношению к двухцепочечной ДНК, поэтому на результаты измерения не влияют примеси РНК, нуклеотидов и белков. Другие примеси в незначительном количестве, такие как соли, детергенты и растворители, оказывают несущественное влияние на результаты измерений. Данный набор позволяет точно измерять концентрацию дцДНК в диапазоне от 100 пг/мкл до 1000 нг/мкл для исходного образца (диапазон количества ДНК для измерения на флуориметре: 2–1000 нг ДНК в 200 мкл образца для измерения). Основной компонент набора — флуоресцентный краситель QuDye dsDNA BR, селективно связывающий ДНК и проявляющий выраженную флуоресценцию в составе комплекса с молекулой ДНК. Использование данного набора является удобным способом квантификации дцДНК в широком диапазоне концентраций, он не требует большого объема исходного образца (1–20 мкл), все измерения проводятся при комнатной температуре и занимают, в среднем, 15-20 минут (в зависимости от количества образцов); флуоресценция образцов стабильна в течение 3 часов. Для проведения измерения необходимо приготовить рабочий раствор красителя, развести в нем в отдельных пробирках стандарты концентрации ДНК и экспериментальные образцы и провести измерения интенсивности флуоресценции на флуориметре. Для удобства мы предлагаем фасовки набора, включающие совместимые с флуориметром тонкостенные пробирки. Кроме этого, данный набор можно использовать в сочетании с набором QuDye Protein Quantification Kit для определения примеси белка в образце ДНК. Для количественного анализа образцов с меньшей концентрацией дцДНК воспользуйтесь набором QuDye dsDNA HS Assay Kit с диапазоном измеряемых концентраций 10 пг/мкл—100 нг/мкл для исходного образца.

Смесь дНТФ представляет собой водный раствор четырех высокоочищенных ,2’-дезоксинуклеозид-5’-трифосфатов (дАТФ, дТТФ, дГТФ, дЦТФ) в эквимолярной концентрации.

Магнитный сорбент ExtraGen® представляет собой водную суспензию твердофазных магнитных частиц на основе оксида железа и оксида кремния. Он предназначен для выделения нуклеиновых кислот из клинических и биологических образцов. Суспензия магнитного сорбента обладает «промежуточной» седиментационной устойчивостью, что особенно важно при использовании материала в автоматических системах выделения ДНК. Частицы ExtraGen® устойчивы к нагреву, сильным окислителям и интенсивным механическим воздей­ствиям (центрифугирование, дисперги­рование и т.п.). Использование фирменного буферного раствора позволяет хранить частицы при комнатной температуре в течение года без ухудшения их сорбционных свойств. Как показали испытания, сорбент ExtraGen® проявляет высокую эффективность при выделении нуклеиновых кислот как в ручном режиме, так и с использованием автоматических станций.

Краситель QuDye dsDNA HS, 200× — реагент для количественного анализа, высокоселективен в отношении дцДНК по сравнению с оцДНК и РНК. Для приготовления рабочего раствора концентрированный реагент QuDye dsDNA HS необходимо развести в соотношении 1:200. Использование реагента QuDye dsDNA HS является более чувствительным методом по сравнению с другими традиционными методами количественного анализа ДНК и предназначен для использования со всеми моделями флуорометров. Концентрированный раствор 200× также является компонентом набора QuDye dsDNA HS для измерения количества двухцепочечной ДНК.

PreciseGreen — ДНК-связывающий краситель на основе бензотиазола. 200-кратный раствор в ДМСО. Это флуоресцентный сенсор, специфичный в отношении двухцепочечной ДНК. Его эмиссию в канале флуоресцеина можно легко детектировать и измерять с помощью кюветного флуориметра, флуориметра для микропланшетов, и с помощью специальных устройств для измерения количества ДНК. PreciseGreen примечателен тем, что флуоресцентный сигнал прямо пропорционален концентрации ДНК в диапазоне от десятков пикограмм до сотен нанограмм в миллилитре образца. Также доступен готовый набор с данным красителем.

Набор предназначен для высокоэффективного и быстрого выделения геномной ДНК из цельной крови и соскобов эпителия с использованием магнитных частиц. Данный набор призван обеспечить высокую производительность при выделении ДНК из большого количества образцов. Он совместим как с автоматическими рабочими станциями для выделения нуклеиновых кислот, так и с ручным выделением с использованием магнитного штатива. Выделение геномной ДНК проходит в два этапа. На первом этапе осуществляется подготовка образца: в него добавляют смесь магнитных частиц и протеиназы К, затем лизирующий раствор. На втором этапе производится промывка и последующая элюция геномной ДНК, сорбированной на магнитных частицах, с использованием автоматической станции или магнитного штатива. Выделенная геномная ДНК не содержит белков и других примесей. Процедура очистки ДНК на магнитных частицах с использованием автоматических станций позволяет обрабатывать большое количество образцов параллельно, что обеспечивает удобство и сокращает время работы с образцами, а также повышает воспроизводимость и надежность получаемых результатов.

6-FAM-11-2’-дезоксиуридин-5’-трифосфат, трилитиевая соль, является широко используемым соединением для нерадиоактивного мечения ДНК. FAM — флуоресцеин, популярный краситель с эмиссией в зеленой области спектра, с максимумом флуоресценции при 513 нм. Данное производное представляет собой чистый 6-изомер FAM. 6-FAM-11-dUTP — модифицированный трифосфат, способный встраиваться в ДНК вместо dTTP различными ферментами, в том числе фрагментом Кленова, Taq-полизмеразой, ДНК-полимеразой I, Phi 29 полимеразой, обратной транскриптазой или терминальной трансферазой. В отличие от трифосфатов с красителем, напрямую связанным с аминоаллил-dUTP, этот трифосфат содержит линкер из 11 атомов между флуорофором и азотистым основанием. Такая длина линкера предотвращает возможное статическое тушение FAM-метки, а также повышает эффективность инкорпорирования нуклеотида во время синтеза цепи ДНК. FAM-11-dUTP можно использовать для получения меченого продукта во время ПЦР и синтеза кДНК, получения меченых ДНК-зондов методом случайных праймеров или Nick-трансляции. Полученные флуоресцентно-меченные ДНК-зонды могут быть использованы для идентификации исследуемых последовательностей с помощью Саузерн-блота, Нозерн-блота, гибридизации in situ или при анализе с использованием микрочипов.

Меченые нуклеозидтрифосфаты (dNTP) позволяют легко метить молекулы ДНК ферментативным путем. Таким способом получают ДНК-микрочипы, ПЦР-ампликоны и обратные транскрипты. sulfo-Cyanine3 - краситель, обладающий эмиссией в желтой части спектра. Наряду с sulfo-Cyanine5, это один из стандартных флуорофоров для проведения экспериментов на ДНК-чипах. sulfo-Cyanine3 dUTP - трифосфат, обеспечивающий высокую эффективность реакций мечения даже при использовании простых ферментов, таких как Taq-полимераза. Качество каждой партии контролируется с помощью ВЭЖХ-МС и тестирования в ферментативной реакции.

Набор предназначен для выделения тотальной ДНК (геномной, митохондриальной и вирусной) из биологических образцов на спин-колонках. В набор входят все необходимые компоненты. На первом этапе с помощью лизирующего раствора с добавлением протеиназы К осуществляется лизис клеток. После этого лизат наносят на колонку, при этом лизирующий раствор способствует селективному связыванию ДНК с мембраной колонки. На следующем этапе производится серия последовательных промывок ДНК, сорбированной на колонке. Особый состав промывочных растворов способствует полному удалению примесей. На заключительном этапе ДНК элюируется с колонки специально подобранным буфером или, при необходимости, деионизованной водой.

Осаждающий буфер «ALPREP PRC» – это реагент, предназначенный для эффективного связывания нуклеиновых кислот со связывающим материалом-носителем. Принцип метода основан на связывании нуклеиновых кислот со связывающим материалом-носителем за счёт присутствия в составе буфера хаотропных веществ и детергентов. Буфер «ALPREP PRC» поставляется в виде концентрата. Перед первым использованием добавьте изопропанол (100%), как указано на бутылке.

Genta-ALP щелочная фосфатаза термолабильная катализирует отщепление 5’- и 3’-фосфатных групп от ДНК, РНК, олигонуклеотидов, нуклеозидтрифосфатов, а также дефосфорилирование белков. Активна в ПЦР-буфере. Выделена из штамма Escherichia coli, экспрессирующего ген щелочной фосфатазы из Gadus morua.

Данный набор предназначен для быстрого и высокоэффективного выделения ДНК из агарозного геля или очистки ДНК из реакционной смеси. Фрагмент геля с целевой ДНК вырезают из агарозного геля и переносят в отдельную пробирку. Буфер для растворения геля обеспечивает растворение агарозы, денатурацию белков, способствует связыванию ДНК с мембраной колонки, а также содержит цветовой индикатор, который позволяет контролировать значение pH раствора. В случае сдвига pH в щелочную сторону, добавление нейтрализующего буфера снижает pH до значения, оптимального для связывания ДНК с мембраной колонки. На следующем этапе производится серия последовательных промывок мембраны колонки, на которой сорбирована ДНК. Особый состав промывочных растворов способствует полному удалению примесей. На заключительном этапе ДНК смывают с колонки элюирующим буфером или деионизованной водой.

Протеиназа «ALZYME K» предназначена для очистки ферментативных смесей и клеточных лизатов от нежелательных белков при выделении РНК/ДНК из микроорганизмов, клеточных культур, растений и других образцов, для инактивации нуклеаз и повышения эффективности лизиса тканей при выделении нуклеиновых кислот.

Ли­зи­ру­ю­щий бу­фер «ALPREP BTA» – это ре­а­гент, ко­­то­­рый эф­­фек­­тив­­но раз­­ру­­ша­ет слож­­ные мат­­ри­­цы, уда­­ля­ет ин­­ги­­би­то­ры, встре­­ча­ю­­щи­е­­ся в кри­­ми­­на­­ли­с­ти­­че­с­ких об­раз­­цах, и эф­фек­­тив­­но вы­­де­­ля­ет ДНК в со­­че­­та­нии с на­бо­ра­ми «ALPREP Forensic», «ALPREP Forensic Plus», «ALPREP Forensic Auto». Пред­­на­з­на­­чен для та­­ких об­раз­­цов су­­деб­­ной экс­­пер­­ти­­зы как зуб­­ной и кост­­ный по­­ро­­шок. Об­ласть при­ме­не­ния: Про­фес­си­о­наль­ное при­ме­не­ние в на­уч­но-ис­сле­до­ва­тельских це­лях, в спе­ци­а­ли­зи­ро­ван­ных ла­бо­ра­то­ри­ях учре­жде­ний кри­ми­на­ли­сти­че­ских экс­пер­тиз/су­деб­но-экс­перт­ных ор­га­ни­за­ци­ях. Преимущество: от­сут­ствие чу­же­род­ных ДНК/РНК раз­лич­ной этио­ло­гии, ДН­Каз/РН­Каз в на­бо­рах под­твер­жде­но в ак­кре­ди­то­ван­ной, на со­о­т­вет­ствие тре­бо­ва­ни­ям ИСО 17025, ла­бо­ра­то­рии.