Набор PreciseGreen для определения количества дцДНК

Набор содержит концентрированный раствор флуоресцентного красителя QuDye HS reagent, буфер для разведения и стандарты концентрации ДНК (0 и 10 нг/мкл). При смешивании с образцом, краситель селективно связывается с двухцепочечной ДНК, но не с РНК, обеспечивая точное измерение концентрации от 10 пг/мкл до 100 нг/мкл (начальная концентрация образца). Анализ выполняется при комнатной температуре, уровень флуоресценции остается стабильным в течение 3 часов. На измерение концентрации не оказывают влияния примеси (белки, отдельные нуклеотиды, соли, детергенты и др.) Флуориметр позволяет проводить измерения в 200 мкл (при объеме исходного образца 1-20 мкл). Кроме того, краситель QuDye HS reagent обладает очень широким линейным диапазоном зависимости уровня сигнала от концентрации dsDNA. Эти два фактора делают данный набор быстрым и удобным средством количественного определения двухцепочечной ДНК.

В наборе используется технология сорбции ДНК на магнитных частицах. Весь процесс выделения ДНК сочетает в себе этапы лизиса образца, последующее селективное связывание высвобожденной ДНК с магнитными частицами, а затем, после серии промывок, элюцию с возможностью концентрирования ДНК в низкосолевом буфере. Преимущества набора: • Высокий выход геномной ДНК из клеток E.coli и эукариот: 4-5 мкг ДНК из 0.5-1*109 бактериальных клеток и 0,25-1* 106 эукариотических клеток. • Высокий выход геномной ДНК при выделении из различных мышиных тканей и органов. • Показатели А260/280 = 1,80±0,05, А260/230 ≥ 2,1 • Проверено, что очищенная ДНК не содержит белков, нуклеаз или других примесей и может быть использована в широком спектре методов молекулярной биологии, таких как ПЦР, ПЦР-РВ или других реакций с участием ферментов. • Высокая производительность при выделении ДНК из большого количества образцов.

Краситель QuDye dsDNA BR высокоселективен в отношении двухцепочечной ДНК (дцДНК), что позволяет определять количественно двухцепочечную ДНК в широком диапазоне концентраций, и присутствие одноцепочечной ДНК, РНК, белков или свободных нуклеотидов не оказывает влияния на результаты измерений. Концентрированный раствор 200× также является компонентом набора QuDye dsDNA BR для измерения количества двухцепочечной ДНК, который может использоваться с самыми распространенными моделями ридеров.

 Преимущества набора: • ДНК из любых реакционных смесей, фрагменты длины от 70 до 20000 п. о. • Показатели А260/280 = 1,80±0,05, А260/230 ≥ 2,0 • Выделенный ПЦР-продукт пригоден для проведения лигирования, рестрикции, трансформации, секвенирования, ПЦР.

10X SNPdetect буфер не содержит ионы магния. Для оптимизации концентрации ионов магния в реакционной смеси используйте 50 мМ раствор MgCl2. При концентрации 2.5 мМ, как правило, достигается наиболее эффективная дискриминация аллелей. Поскольку магний является кофактором полимеразы, увеличение концентрации ионов Mg2+ увеличивает выход реакции. Однако, одновременно снижается её специфичность и растет неспецифическая (фоновая) амплификация. В связи с тем, что ионы магния являются кофактором полимеразы, увеличение концентрации ионов Mg2+ увеличивает выход реакции, одновременно понижая ее специфичность и повышая фоновую амплификацию.

50Х TAE электродный буфер предназначен для приготовления агарозных и полиакриламидных гелей. Использование 50Х TAE рекомендовано для: – разделения длинных фрагментов нуклеиновых кислот (более 2 000 п.о.), – электрофореза с последующим выделением ДНК из геля. В состав буфера входит: 2М Трис-(гидроксиметил) аминометан, 50мМ ЭДТА, 1М уксусная кислота, вода высокой степени очистки, pH 8.3. Буфер профильтрован через мембрану с размером пор 0.45 мкм.

10X Taq Turbo буфер для Taq и HS Taq ДНК полимераз (кат. ## PK113S/L/H, PK114, PK017S/L/H, PK018) подходит для использования в большинстве приложений ПЦР, включая ПЦР в режиме реального времени с интеркалирующими красителями SYBR Green I или Eva Green, а также ПЦР с любыми флуоресцентными зондами. Благодаря усовершенствованному составу 10X Taq Turbo буфер обеспечивает значительно более высокую эффективность ПЦР, чем большинство стандартных буферов для Taq ДНК полимераз. Концентрация Mg2+ в 10X буфере — 25 мМ. При 25 °C буфер имеет pH=8.3.

Буфер используется для разведения и хранения MMLV ревертазы в тех случаях, когда на реакцию требуется менее 100 ед. фермента. Для повышения точности замешивания реакции мы рекомендуем подбирать разведение так, чтобы конечный объем фермента, добавляемого в реакционную смесь, был не менее 1 мкл.

10 мМ Трис-HCl, 0.1 мМ ЭДТА, pH 8.0. Для приготовления использована деионизованная вода для ПЦР. Применение: Буфер используется для разведения ДНК перед постановкой ПЦР (или иных ферментативных реакций). Может использоваться для элюции ДНК с колонок и магнитных частиц. Растворенная в буфере ДНК может длительно храниться в замороженном виде. При добавлении буфера в реакционную смесь при постановке ПЦР практически не изменяется рН раствора и концентрация ионов магния, поэтому эффективность амплификации не снижается. При использовании для разведения ДНК стандартного ТЕ-буфера относительно высокая концентрация ЭДТА в растворе ДНК (1 мМ ЭДТА) может быть причиной снижения эффективности ПЦР вследствие хелатирования ионов магния. Не содержит нуклеаз.

DTT (дитиотреитол) предназначен для стабилизации и сохранения активности белков, имеющих сульфгидрильные (тиоловые) группы. Раствор DTT используется в буферах для хранения белков и ферментативных реакциях, например, в ПЦР или реакции синтеза первой цепи кДНК.

10 мМ Трис-НCl, 1 мМ EDTA (pH 8.0). Для приготовления используется сверхчистая деионизованная вода. Не содержит нуклеаз и примесей нуклеиновых кислот. Применение: Буфер TE готов к использованию. Применяется в молекулярной биологии: • для элюции с колонок и магнитных частиц, приготовления препаратов нуклеиновых кислот (ДНК, РНК, кДНК); • для приготовления растворов. Буфер ТЕ способствует длительному хранению нуклеиновых кислот в замороженном виде.

10X Overnight ligation buffer применяется для стандартного лигирования (14–16 часов при 14 °C). Буферы оптимизированы для использования с Quick-TA и T4 ДНК лигазами. В состав обоих буферов входят АТФ и ДТТ, которые плохо сохраняются в водных растворах, поэтому буфер не следует оставлять при комнатной температуре после окончания работы.

5X Quick ligation buffer предназначен для быстрого лигирования (5–15 минут при комнатной температуре). Буферы оптимизированы для использования с Quick-TA и T4 ДНК лигазами. В состав обоих буферов входят АТФ и ДТТ, которые плохо сохраняются в водных растворах, поэтому буфер не следует оставлять при комнатной температуре после окончания работы.

Буферы и 5X Tersus Red предназначен для работы со смесью полимераз Tersus. Концентрация ионов магния в в 5X Tersus Red буфере — 12,5 мM. При использовании в рекомендованных разведениях каждый буфер обеспечивает 2,5 мM концентрацию ионов магния в ПЦР реакции. 5Х Tersus Red буфер содержит красный и желтый красители, не влияющие на работу полимеразы, и компоненты, увеличивающие плотность пробы для удобства нанесения на гель. Буфер удобно использовать для постановки реакций, продукты которых впоследствии анализируются с помощью гель-электрофореза. Продукт ПЦР сразу наносится в гель без добавления буфера для нанесения проб. В 1% агарозном геле с 1X ТАЕ буфером электрофоретическая подвижность красного красителя соответствует фрагменту ДНК размером 1000 п.о., желтый краситель мигрирует с фронтом на уровне фрагментов 20–30 п.о.

50Х TAE электродный буфер предназначен для приготовления агарозных и полиакриламидных гелей. Использование 50Х TAE рекомендовано для: – разделения длинных фрагментов нуклеиновых кислот (более 2 000 п.о.), – электрофореза с последующим выделением ДНК из геля. В состав буфера входит: 2М Трис-(гидроксиметил) аминометан, 50мМ ЭДТА, 1М уксусная кислота, вода высокой степени очистки, pH 8.3. Буфер профильтрован через мембрану с размером пор 0.45 мкм.

10Х TBE электродный буфер предназначен для приготовления агарозных и полиакриламидных гелей. Использование 10Х TBE рекомендовано для: – разделения коротких фрагментов нуклеиновых кислот (менее 1500 п.о.), – продолжительных электрофорезов. В состав буфера входит: 890 мМ Трис-(гидроксиметил) аминометан, 890 мМ борная кислота, 20мМ ЭДТА, вода высокой степени очистки, pH 8.3. Буфер профильтрован через мембрану с размером пор 0.45 мкм.