ExtractDNA FFPE

В основе протокола лежит модифицированный метод щелочного лизиса бактериальной культуры без предварительного осаждения бактерий с последующим селективным связыванием ДНК из осветленного лизата на силиконизированной мембране колонки. Технология позволяет ускорить процесс выделения за счет быстрого лизиса напрямую из биомассы с обработкой РНКазой А лизата и дальнейшего центрифугирования. Преимущества набора: Выход до 10 мкг из 0,6 мл бактериальной культуры Показатели А260/280 = 1,80±0,05, А260/230 ≥ 2,1 Проверено, что плазмидная ДНК пригодна для реакции рестрикции, трансформации, секвенирования, ПЦР

Genta TaqF ДНК-полимераза — химически модифицированный рекомбинантный аналог ДНК-полимеразы из термофильной бактерии Thermus aquaticus. Фермент обладает 5’-3’ полимеразной активностью и 5’-3’ экзонуклеазной активностью, но не имеет 3’-5’ корректирующую экзонуклеазную активность. Рекомбинантный фермент Genta TaqF ДНК-полимераза подходит для использования в рутинных ПЦР, включая ПЦР в режиме реального времени. Genta TaqF ДНК-полимераза инактивирована с помощью химической модификации, что позволяет проводить приготовление реакционной смеси при комнатной температуре. Наличие «горячего старта» повышает специфичность и чувствительность амплификации. Активация полимеразы происходит при её прогревании до 95°C в течение 15 минут.

Набор предназначен для очистки фрагментов двухцепочечной ДНК из агарозного геля. Очищенная ДНК пригодна для ПЦР, секвенирования, рестрикции, лигирования и других молекулярно-биологических приложений.

sulfo-Cyanine5.5 - краситель, обладающий эмиссией в дальней красной области. Этот флуорофор обеспечивает высокое качество флуоресцентного сигнала благодаря тому, что практически никакие биологические источники флуоресцентного фона не обладают эмиссией в его диапазоне. Эта молекула представляет собой модифицированный дезоксиуридинтрифосфат (dUTP). Она является субстратом для широкого спектра полимераз, включая обычную Taq-полимеразу. Благодаря тому, что нуклеотид и краситель разделяет удлиненный линкер амино-11, этот реагент представляет собой лучшую альтернативу для замены меченых трифосфатов на основе аминоаллил-dUTP. Контроль качества трифосфатов включает в себя ВЭЖХ-МС и тестирование в ферментативной реакции.

Genta-ExoI экзонуклеаза I гидролизует одноцепочечную ДНК в 3 '→ 5' направлении, высвобождая дезоксирибонуклеозид 5'-монофосфат. Не расщепляет цепи ДНК, 3’-конец которых блокирован фосфорильной или ацетильной группой. Активна в ПЦР-буфере. Выделена из штамма Escherichia coli, экспрессирующего ген экзонуклеазы I E.coli.

На­бор ре­а­ген­тов «AL­PREP Gel Co­lumn» пред­на­зна­чен для вы­де­ле­ния ДНК из ага­роз­но­го ге­ля. Вы­де­ле­ние ДНК ос­но­ва­но на при­ме­не­нии мик­ро­цен­три­фуж­ных ко­ло­нок с сорб­ци­он­ны­ми мем­бра­на­ми. Очи­щен­ная ДНК при­год­на для по­сле­дую­ще­го ис­поль­зо­ва­ния в ПЦР, ПЦР-РВ, рест­рик­ции, ли­ги­ро­ва­нии, про­бо­под­го­тов­ки для сек­ве­ни­ро­ва­ния ме­то­да­ми Сэн­ге­ра и NGS, а так­же в иных ген­но-ин­же­нер­ных при­ло­же­ни­ях. Прин­цип ра­бо­ты на­бо­ра ре­а­ген­тов «AL­PREP Gel Co­lumn» за­клю­ча­ет­ся в об­ра­ти­мом свя­зы­ва­нии мо­ле­кул нук­ле­и­но­вых кис­лот на по­верх­но­сти мем­бра­ны ко­лон­ки по­сле об­ра­бот­ки ис­поль­зу­е­мо­го об­раз­ца ком­по­нен­та­ми на­бо­ра. На­бор пред­наз­на­чен для при­ме­не­ния в на­уч­но-ис­сле­до­ва­тель­ских це­лях. Характеристики: - Размер ДНК: 70-10000 п.о. - Выделение ДНК из всех типов агарозы. - Концентрация агарозы в геле до 3%. - Выход фрагментов ДНК после очистки от 80%. - Нет стадий переосаждения ДНК изопропанолом/этанолом и хлороформ-фенольной экстракции. - Время выделения и очистки - 35 минут.

Genta-RT kit представляет собой набор реагентов для проведения синтеза первой цепи кДНК на матрице РНК. Набор включает в себя: in silico модифицированный гомолог обратной транскриптазы вируса лейкемии мышей Молони (MMLV) – Genta REV M ревертазу; Олиго(dT)18 праймер; воду для ПЦР и 2 вида 5-кратного реакционного буфера (включающего в себя дНТФ и ДТТ): 5х ОТ-буфер R – наличие Random-праймеров в реакционном буфере позволяет проводить синтез тотальной кДНК. 5х ОТ-буфер – требуется добавление специфических праймеров для синтеза целевого фрагмента кДНК; или добавление Олиго(dT)18 праймера для полиаденилированной РНК.

Набор предназначен для очистки фрагментов двухцепочечной ДНК из агарозного геля. Очищенная ДНК пригодна для ПЦР, секвенирования, рестрикции, лигирования и других молекулярно-биологических приложений.

Набор предназначен для очистки фрагментов двухцепочечной ДНК из ферментативных реакционных смесей (ПЦР, рестрикция, лигирование и т.д.). Очищенная ДНК пригодна для ПЦР, секвенирования, рестрикции, лигирования, трансформации, трансфекции и других молекулярно-биологических приложений.

Набор предназначен для выделения плазмидной ДНК из бактерий. Принцип работы набора основан на щелочном лизисе обработанного РНКазой биоматериала с последующим селективным связыванием ДНК из осветленного лизата на силиконизированной мембране колонки. Окрашенные растворы в наборе позволяют контролировать правильный порядок добавления компонентов, полноту лизиса и нейтрализации. Преимущества набора: • Выход до до 25 мкг из 2 мл бактериальной культуры и до 60* мкг из 6-10 мл бактериальной культуры • Показатели А260/280 = 1,80±0,05, А260/230 ≥ 2,1 • Проверено, что плазмидная ДНК пригодна для реакции рестрикции, трансформации, секвенирования, ПЦР, трансфекции. *выход продукта зависит от копийности плазмиды, объема культуры и условий культивирования

dsGold (также известен как Oxazole Gold) является асимметричным цианиновым красителем, используемым для окрашивания дцДНК, оцДНК и РНК в электрофоретических гелях. dsGold демонстрирует более чем 1000-кратное увеличение флуоресценции при связывании с нуклеиновыми кислотами и имеет самый высокий квантовый выход (0,6-0,7) по сравнению с другими красителями, такими как бромистый этидий (EtBr), dsGreen и ssGreen. Комплексы красителя с нуклеиновыми кислотами имеют два максимума возбуждения флуоресценции — при 300 нм и 495 нм, и один максимум излучения при 546 нм. Таким образом, гели, окрашенные с помощью dsGold, могут быть визуализированы с использованием как ультрафиолетовых, так и синих транслиминаторов с соответствующими светофильтрами. Чувствительность dsGold позволяет обнаруживать всего 25 пг ДНК в денатурирующих гелях с мочевиной, глиоксалом и формальдегидом. Краситель способен быстро проникать в толстые и высокопроцентные агарозные гели. Из-за низкой флуоресценции несвязанного красителя, гели с формальдегидом не требуют процедуры удаления красителя. Присутствие dsGold в окрашенных гелях в стандартных рабочих концентрациях не мешает Т4 ДНК-лигазе, Taq-полимеразе, эндонуклеазам рестрикции или нозерн- или Саузерн-блоттингу. Краситель можно легко удалить из нуклеиновых кислот путем осаждения этанолом, оставляя чистые матрицы доступными для последующих манипуляций или анализа. Мы предлагаем dsGold в виде 10 000-кратного концентрата в ДМСО. Для окрашивания геля разведите концентрат в буфере TE, TBE или TAE и инкубируйте гель в 1× окрашивающем растворе в течение 10-40 мин.

6-Флуоресцеиновое (FAM) производное дезоксицитидинтрифосфата (dCTP). 6-изомер FAM — широко используемый для мечения биомолекул флуорофор, обладающий высоким квантовым выходом и яркой эмиссией в зеленой области спектра. FAM-11-dCTP может применяться для ферментативного мечения ДНК посредством Nick-трансляции, 3’-концевого мечения, в методе случайных праймеров, в процессе ПЦР или синтеза кДНК. FAM-11-dCTP встраивается в растущую цепь ДНК Taq-полизмеразой, ДНК-полимеразой I, Phi 29 полимеразой, фрагментом Кленова, обратной транскриптазой или терминальной трансферазой. Длина линкера из 11 атомов углерода оптимальна для эффективного включения флуоресцентно-меченого dCTP в растущую цепь ДНК. Меченная таким образом ДНК подходит для FISH-экспериментов или определения профиля экспрессии генов с помощью микрочипов, а также для использования в Саузерн-блоте и Нозерн-блоте.

Набор предназначен для выделения плазмидной ДНК высокой степени очистки из культуры клеток E.coli. Выделенная ДНК пригодна для ПЦР, секвенирования, рестрикции, трансформации, трансфекции и других молекулярно-биологических приложений.

Набор предназначен для высокоэффективного и быстрого выделения геномной ДНК из цельной крови и соскобов эпителия с использованием магнитных частиц. Данный набор призван обеспечить высокую производительность при выделении ДНК из большого количества образцов. Он совместим как с автоматическими рабочими станциями для выделения нуклеиновых кислот, так и с ручным выделением с использованием магнитного штатива. Выделение геномной ДНК проходит в два этапа. На первом этапе осуществляется подготовка образца: в него добавляют смесь магнитных частиц и протеиназы К, затем лизирующий раствор. На втором этапе производится промывка и последующая элюция геномной ДНК, сорбированной на магнитных частицах, с использованием автоматической станции или магнитного штатива. Выделенная геномная ДНК не содержит белков и других примесей. Процедура очистки ДНК на магнитных частицах с использованием автоматических станций позволяет обрабатывать большое количество образцов параллельно, что обеспечивает удобство и сокращает время работы с образцами, а также повышает воспроизводимость и надежность получаемых результатов.

«ALPREP Plasmid Magnetic» предназначен для выделения плазмидной ДНК из жидких культур бактериальных клеток методом магнитной сорбции. Выделенная плазмидная ДНК пригодна для ПЦР, ПЦР-РВ, рестрикции, лигирования, трансформации, трансфекции, а также в иных генно-инженерных приложениях. Набор предназначен для применения в научно-исследовательских целях. Характеристики: - с помощью набора проводится выделение плазмидной ДНК из жидкой бактериальной культуры; - компоненты набора обеспечивают полное удаление солей, белков, РНК и других клеточных компонентов; - полученная ДНК отличается высокой степенью чистоты; - набор позволяет элюировать плазмидную ДНК в объеме от 30 до 100 мкл; - эффективность выделения плазмидной ДНК данным набором составляет >85%; - выход плазмидной ДНК до 20 мкг; - время выполнения протокола составляет 30 минут.

Олигонуклеотид с 10 полностью вырожденными нуклеотидами, может быть использован как универсальный праймер для синтеза кДНК методом обратной транскрипции и ПЦР с обратной транскрипцией (ОТ-ПЦР). Случайный декануклеотидный праймер является одним из популярных стоковых олигонуклеотидов.

Магнитный сорбент ExtraGen® представляет собой водную суспензию твердофазных магнитных частиц на основе оксида железа и оксида кремния. Он предназначен для выделения нуклеиновых кислот из клинических и биологических образцов. Суспензия магнитного сорбента обладает «промежуточной» седиментационной устойчивостью, что особенно важно при использовании материала в автоматических системах выделения ДНК. Частицы ExtraGen® устойчивы к нагреву, сильным окислителям и интенсивным механическим воздей­ствиям (центрифугирование, дисперги­рование и т.п.). Использование фирменного буферного раствора позволяет хранить частицы при комнатной температуре в течение года без ухудшения их сорбционных свойств. Как показали испытания, сорбент ExtraGen® проявляет высокую эффективность при выделении нуклеиновых кислот как в ручном режиме, так и с использованием автоматических станций.