ExtractDNA FFPE

ExoGen представляет собой готовую для использования смесь ферментов Genta-ExoI экзонуклеазы I и термолабильной щелочной фосфатазы Genta-ALP в реакционном буфере. Смесь ExoGen применяется для ферментативного гидролиза избыточного количества праймеров и нуклеотидов в продуктах ПЦР (ампликонах). Очищенные таким образом ПЦР-продукты пригодны для дальнейшего использования в различных биологических приложениях, таких как клонирование и ДНК-секвенирование.

5-кратный реакционный буфер, не содержащий сульфат магния.

Амино-11-ddUTP - терминирующий трифосфат для ферментативного мечения 3'-конца ДНК аминогруппой. Нуклеотид включается в ДНК Taq-полимеразой, секвеназой, фрагментом Кленова. ДНК с аминогруппой может быть помечена активированными эфирами, в том числе флуоресцентных красителей.

5х Genta ТЕ-буфер для разведения нуклеиновых кислот. Состав: 10 мМ Трис*НCl, 1 мМ ЭДТА, pH 8,0. Приготовлен на сверхчистой воде.

sulfo-Cyanine5.5 - краситель, обладающий эмиссией в дальней красной области. Этот флуорофор обеспечивает высокое качество флуоресцентного сигнала благодаря тому, что практически никакие биологические источники флуоресцентного фона не обладают эмиссией в его диапазоне. Эта молекула представляет собой модифицированный дезоксиуридинтрифосфат (dUTP). Она является субстратом для широкого спектра полимераз, включая обычную Taq-полимеразу. Благодаря тому, что нуклеотид и краситель разделяет удлиненный линкер амино-11, этот реагент представляет собой лучшую альтернативу для замены меченых трифосфатов на основе аминоаллил-dUTP. Контроль качества трифосфатов включает в себя ВЭЖХ-МС и тестирование в ферментативной реакции.

sulfo-Cyanine5 dUTP - модифицированный трифосфат для ферментативного мечения ДНК, аналог Cy5-dUTP. В отличие от трифосфатов, содержащих краситель, напрямую связанный с аминоаллил-dUTP, этот трифосфат содержит линкер, повышающий эффективность его встраивания обычными полимеразами типа Taq-полимеразы. sulfo-Cyanine5 - яркий краситель для дальней красной области (канал Cy5). Трифосфат поставляется в виде лиофилизированной литиевой соли.

Материал для проведения процедуры. Для исследования подходят образцы цельной крови, обработанные такими антикоагулянтами как цитрат, ЭДТА, гепарин. Можно использовать как свежие, так и замороженные образцы. Выход и качество очищенной ДНК зависят от условий хранения крови. Аналитические характеристики. Набор реагентов «ALPREP Spin Blood Auto» обеспечивает выделение ДНК с чистотой не менее 1,8 по показателю соотношения А260/А280; количество выделяемой ДНК составляет не менее 2–10 мкг.

Набор предназначен для быстрого и высокоэффективного выделения геномной ДНК из широкого спектра биологических образцов на спин-колонках. В набор входят все необходимые компоненты. На первом этапе с помощью лизирующего раствора с добавлением протеиназы К осуществляется лизис клеток. К полученному лизату добавляется сорбирующий раствор, способствующий селективному связыванию ДНК с мембраной колонки. На следующем этапе производится серия последовательных промывок ДНК, сорбированной на колонке. Особый состав промывочных растворов способствует полному удалению примесей. На заключительном этапе ДНК элюируется с колонки специально подобранным буфером или, при необходимости, деионизованной водой. В состав набора также входят: корунд и пестики-гомогенизаторы для гомогенизации образцов из тканей растений и животных, раствор РНКазы для эффективного удаления примеси РНК, раствор для лизиса эритроцитов (в случае предварительного выделения лейкоцитов из цельной крови, что обеспечивает более высокий выход ДНК по сравнению с выделением ДНК из цельной крови).

Магнитные частицы CleanMag DNA PCR предназначены для эффективной очистки фрагментов ДНК из ферментативных реакционных смесей. CleanMag DNA PCR оптимален для работы с редкими образцами и малым количеством исходного материала. Выделенная ДНК пригодна для ПЦР, рестрикции, лигирования и других молекулярно-биологических приложений.

Олигонуклеотид с 10 полностью вырожденными нуклеотидами, может быть использован как универсальный праймер для синтеза кДНК методом обратной транскрипции и ПЦР с обратной транскрипцией (ОТ-ПЦР). Случайный декануклеотидный праймер является одним из популярных стоковых олигонуклеотидов.

Набор предназначен для очистки фрагментов двухцепочечной ДНК из агарозного геля и ферментативных реакционных смесей (ПЦР, рестрикция, лигирование и т.д.). Очищенная ДНК пригодна для ПЦР, секвенирования, рестрикции, лигирования, трансформации, трансфекции и других молекулярно-биологических приложений.

Набор предназначен для быстрого выделения плазмидной ДНК высокой степени очистки из культуры клеток E. coli. Выделенная ДНК пригодна для ПЦР, секвенирования, рестрикции, трансформации, трансфекции и других молекулярно-биологических приложений.

Амино-11-dCTP имеет модификацию по основанию в 5-м положении пиримидинового цикла для введения первичных аминов в ДНК в ходе ферментативного синтеза, для возможностей последующей модификации с помощью амин-реактивных агентов. Модифицированные нуклеотиды, включая дезоксицитидинтрифосфат (dCTP), используются для введения в ДНК модифицированных нуклеозидов с функциональными группами. Данный реагент является носителем аминогруппы на удлинённом линкере.

dsGreen - чувствительный ДНК-связывающий краситель, специфичный в отношении двухцепочечной ДНК и ДНК-РНК-дуплексов. Он широко используется для детекции нуклеиновых кислот в агарозных и полиакриламидных гелях. В отличие от бромистого этидия, dsGreen высокоселективен в отношении двухцепочечных нуклеиновых кислот, не обладает выраженной мутагенной активностью и обеспечивает намного более высокую чувствительность обнаружения нуклеиновых кислот.

Краситель dsGreen обладает высокой чувствительностью и селективностью в отношении двухцепочечной ДНК. dsGreen применяется для связывания с ДНК и прокраски гелей. Данный продукт представлен в виде твердой формы и может быть использован для приготовления растворов согласно протоколам проводимых исследований. Lumiprobe также производит dsGreen в форме раствора, специально оптимизированного для метода ПЦР реального времени.

Набор содержит концентрированный раствор флуоресцентного красителя QuDye HS reagent, буфер для разведения и стандарты концентрации ДНК (0 и 10 нг/мкл). При смешивании с образцом, краситель селективно связывается с двухцепочечной ДНК, но не с РНК, обеспечивая точное измерение концентрации от 10 пг/мкл до 100 нг/мкл (начальная концентрация образца). Анализ выполняется при комнатной температуре, уровень флуоресценции остается стабильным в течение 3 часов. На измерение концентрации не оказывают влияния примеси (белки, отдельные нуклеотиды, соли, детергенты и др.) Флуориметр позволяет проводить измерения в 200 мкл (при объеме исходного образца 1-20 мкл). Кроме того, краситель QuDye HS reagent обладает очень широким линейным диапазоном зависимости уровня сигнала от концентрации dsDNA. Эти два фактора делают данный набор быстрым и удобным средством количественного определения двухцепочечной ДНК.