Cyanine5 - флуорофор, используемый в количественной ПЦР в реальном времени.
Cyanine5 фосфорамидит используется для синтеза зондов для ПЦР в реальном времени, содержащих Cyanine5 на 5'-конце, наиболее типичном месте расположения флуорофора. Это терминирующий ненуклеозидный агент.
Амидитный фрагмент связан с остальной молекулой через кислородный мостик. Это обеспечивает дополнительную стабильность против перегруппировки Арбузова - реакции, которая приводит к уменьшению содержания амидита в растворе в олигонуклеотидном синтезаторе. Такой молекулярный дизайн увеличивает стабильность реагента, поддерживая эффективное связывание в течение более длительного времени.