ROX NHS-эфир, 6-изомер

Родамин 6G (R6G) - ксантеновый краситель родаминового ряда, в течение длительного времени использующийся для мечения олигонуклеотидов. Как и другие ксантеновые красители, R6G доступен в виде двух изомеров, 5- и 6-. Несмотря на то, что их спектры поглощения и эмиссии практически неразличимы, изомеры все же следует разделять для того, чтобы меченые молекулы не разделялись при очистке методами хроматографии и электрофореза. Активированный эфир 5-R6G - производное для мечения аминогрупп биомолекул, полученное из чистого 5-изомера карбокси-R6G. Родамин 6G - очень яркий краситель. Его используют в качестве стандарта квантового выхода (0.95 в этаноле). Этот флуорофор растворим в органических растворителях, таких как ДМФА и ДМСО. Их следует спользовать в качестве сорастворителей в реакциях мечения.

VIC — несимметричный ксантеновый краситель (два боковых кольца содержат различные заместители). Этот краситель используется для мечения зондов ПЦР реального времени. По спектральным свойствам VIC похож на HEX и JOE. Этот фосфорамидитный реагент позволяет вводить метку по 5’-положению олигонуклеотида.

Олигонуклеотид с 6 полностью вырожденными нуклеотидами, может быть использован как универсальный праймер для синтеза кДНК методом обратной транскрипции и ПЦР с обратной транскрипцией (ОТ-ПЦР). Один из самых популярных стоковых олигонуклеотидов.

Референсный краситель ROX предназначен для ПЦР с детекцией в режиме реального времени (ПЦР-РВ). Референсный краситель ROX: – используется для нормирования интенсивности флуоресцентного сигнала при проведении количественной ПЦР-РВ. – позволяет скорректировать погрешности, связанные с ошибкой автоматического дозатора и флуктуацией флуоресценции.

Азидопроизводное красителя TR (Техасский Красный, или сульфородамин 101 хлорангидрид) для конъюгации с терминальными алкинами посредством медь-катализируемой клик-реакции или с напряженными алкинами посредством безмедной клик-реакции. TR — красный флуоресцентный краситель, используемый для окрашивания клеток, их сортировки с помощью флуоресцентно-активируемых сортировочных машин, флуоресцентной микроскопии. Техасский Красный также широко используется в молекулярной биологии, в основном для количественной ОТ-ПЦР и других методов клеточного анализа.

Genta бензонуклеаза представляет собой нуклеазу, которая расщепляет все виды как ДНК, так и РНК (одноцепочечные, двухцепочечные, линейные и кольцевые) с образованием олигодезоксинуклеотидов с концевыми 5’-монофосфатами длиной 3-5 оснований. Эффективна в широком диапазоне рабочих условий. Не имеет протеолитической активности. Выделена из штамма Escherichia coli, экспрессирующего ген нуклеазы из микроорганизма Serratia marcescens. Условия проведения реакции: 20 - 37°С, оптимальный буфер: 50 мM Трис-HCl (рН 8,0 при 25°С); 100 -150 мM NaCl; 1 мМ MgCl2.

Референсный краситель для ПЦР реального времени (реалтайм-ПЦР). Рекомендуется использовать этот реагент для нормализации интенсивности флуоресценции зондов и интеркалирующих красителей типа dsGreen. Реагент содержит 25 μM родамина 101 в 10 мМ Tris-HCl (pH 8.6), 0.1 мМ EDTA и 0.01% Tween®-20. Референсный краситель ROX совместим со всеми амплификаторами, имеющими канал ROX. Большинство приборов рассчитаны на конечную концентрацию ROX от 50 до 500 нМ.

ProbeMaster® ROX — готовая 5-кратная реакционная смесь, содержащая все необходимые компоненты для проведения количественной ПЦР с применением интеркалирующих красителей или гидролизуемых зондов. Eе состав оптимизирован для получения идеальных результатов с минимальным значением порогового цикла и высоким уровнем отношения сигнал/фон. Формат готовой реакционной смеси снижает риск контаминации образцов. ProbeMaster® ROX позволяет решать большое количество задач с минимальными затратами времени. Смесь подходит для точного определения содержания ДНК матрицы в пробе и может применяться для определения уровня копийности и экспрессии генов, генотипирования, детекции SNP и других приложений.

Eva488 - краситель для ПЦР реального времени, не ингибирующий реакцию и характеризующийся ярким разгоранием. Это аналог Eva Green, димерный акридин, флуоресцирующий при связывании с двухцепочечной ДНК. Флуоресценция красителя Eva488 попадает в канал флуоресцеина. Краситель поставляется в виде раствора в воде концентрации 20×.

Набор для тестирования наличия ДНКаз Genta DNAseAlarm содержит оптимизированные реагенты для быстрого и высокочувствительного анализа присутствия ДНКаз в растворе или смывах с поверхностей. Набор позволяет обнаруживать до 0.001 U ДНКазы I. Набор основан на флуоресцентном зонде с FAM, обладающим минимальной фоновой флуоресценцией, но демонстрирующем сильное увеличение флуоресценции в присутствии ДНКаз, детектируемое как на флуориметре, так и в ПЦР-амплификаторе.

SYBR Green I – интеркалирующий краситель, специфичный к двухцепочечной ДНК. Раствор SYBR Green I оптимизирован для применения в ПЦР с детекцией в режиме реального времени (ПЦР-РВ). Рекомендуется использовать как 50X раствор, при оптимизации условий ПЦР допускается двухкратное увеличение или двухкратное уменьшение (25Х – 100Х) концентрации красителя в реакционной смеси.

SYBR Green I – интеркалирующий краситель, специфичный к двухцепочечной ДНК. Раствор SYBR Green I оптимизирован для применения в ПЦР с детекцией в режиме реального времени (ПЦР-РВ). Рекомендуется использовать как 50X раствор, при оптимизации условий ПЦР допускается двухкратное увеличение или двухкратное уменьшение (25Х – 100Х) концентрации красителя в реакционной смеси.

5х Genta ТЕ-буфер для разведения нуклеиновых кислот. Состав: 10 мМ Трис*НCl, 1 мМ ЭДТА, pH 8,0. Приготовлен на сверхчистой воде.

Genta-RT kit представляет собой набор реагентов для проведения синтеза первой цепи кДНК на матрице РНК. Набор включает в себя: in silico модифицированный гомолог обратной транскриптазы вируса лейкемии мышей Молони (MMLV) – Genta REV M ревертазу; Олиго(dT)18 праймер; воду для ПЦР и 2 вида 5-кратного реакционного буфера (включающего в себя дНТФ и ДТТ): 5х ОТ-буфер R – наличие Random-праймеров в реакционном буфере позволяет проводить синтез тотальной кДНК. 5х ОТ-буфер – требуется добавление специфических праймеров для синтеза целевого фрагмента кДНК; или добавление Олиго(dT)18 праймера для полиаденилированной РНК.

Референсный краситель ROX предназначен для ПЦР с детекцией в режиме реального времени (ПЦР-РВ). Референсный краситель ROX: – используется для нормирования интенсивности флуоресцентного сигнала при проведении количественной ПЦР-РВ. – позволяет скорректировать погрешности, связанные с ошибкой автоматического дозатора и флуктуацией флуоресценции.

 Преимущества набора: • ДНК из любых реакционных смесей, фрагменты длины от 70 до 20000 п. о. • Показатели А260/280 = 1,80±0,05, А260/230 ≥ 2,0 • Выделенный ПЦР-продукт пригоден для проведения лигирования, рестрикции, трансформации, секвенирования, ПЦР.