НАША ЛАБА.БИОТЕХ

Центр коллективного пользования «Биобезопасность и новые технологии» (Федеральное бюджетное учреждение науки «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека)

Центр коллективного пользования «Биобезопасность и новые технологии» создан на базе научных подразделений и лабораторий ведущего научного учреждения РФ ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора. Основной задачей ЦКП является – предоставление заинтересованным пользователям возможности проведения широкого спектра исследований на инновационном научном оборудовании ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора. Главные научные направления деятельности ЦКП «Биобезопасность и новые технологии» включают в себя высокотехнологичные междисциплинарные исследования в области геномики, протеомики и биоинформатики.

Центр коллективного пользования «Биобезопасность и новые технологии» осуществляет следующие виды услуг:

определение генетического варианта ВИЧ-1 на основании анализа нуклеотидных последовательностей генов протеазы, обратной транскриптазы, интегразы и V3 петли белка gp120;
секвенирование всей кодирующей области генома ВИЧ-1 с помощью массового параллельного секвенирования;
идентификация микроорганизмов методом времяпролетной MALDI-TOF масс-спектрометрии;
определение чувствительности к антибиотикам на системе Sensititre;
полногеномное секвенирование бактериальных патогенов на высокопроизводительном секвенаторе второго поколения (короткие прочтения);
полногеномное секвенирование бактериальных патогенов на высокопроизводительном секвенаторе третьего поколения (длинные прочтения);
выделение хромосомной ДНК бактерий и наработка ДНК-фрагментов;
сборка геномов и выявление генов резистентности;
цитофлуориметрический анализ;
сортировка клеток;
определение количества ДНК-мишени с помощью ddPCR (без / с дополнительной обработки рестриктазой);
экстракция образцов (Рибо-золь-D);
экстракция образцов (Рибо-преп);
обратная транскрипция (РЕВЕРТА-L);
секвенирование на платформе MiSeq (парные прочтения (PE), длина прочтения 300 п.о., 1 запуск 20 миллионов пар прочтений);
подготовка библиотек ампликонов 16S;
пробоподготовка библиотек ДНК вирусов (выделение ДНК включено);
пробоподготовка РНК вирусов (выделение РНК включено);
секвенирование фрагментов ДНК (плазмиды, ампликоны);
документирование агарозных (ДНК) и полиакриламидных (белки) гелей; анализ одномерных и двумерных гелей; анализ вестерн- и дот-блотов; детекция флуоресценции, хемилюминесценции (с проведением электрофореза ДНК);
документирование агарозных (ДНК) и полиакриламидных (белки) гелей; анализ одномерных и двумерных гелей; анализ вестерн- и дот-блотов; детекция флуоресценции, хемилюминесценции (с проведением электрофореза белков);
ПЦР в реальном времени с детекцией флуоресценции (с проведением ПЦР в режиме реального времени);
ПЦР в реальном времени с детекцией флуоресценции (с проведением ПЦР в реальном времени (с экстракцией ДНК из биологического материала));
ПЦР в реальном времени с детекцией флуоресценции (с проведением ПЦР в реальном времени (с экстракцией РНК из биологического материала и получением кДНК на матрице РНК));
ПЦР в реальном времени с детекцией флуоресценции (с проведением ОТ-ПЦР в реальном времени с экстракцией РНК из биологического материала);
фракционирование клеточной суспензии;
определение генетических полиморфизмов, связанных и/или ассоциированных с заболеваниями или состояниями, диагностика и генетическая предрасположенность к которым имеет прикладное биомедицинское значение;
биоинформатический анализ данных и подбор олигонуклеотидных праймеров и зондов для цифровой ПЦР;
синтез праймеров;
синтез зондов;
идентификация микроорганизмов на приборе Phoenix M50;
определение чувствительности к противомикробным препаратам на приборе Phoenix M50;
разработка методики для количественной оценки бактериальной ДНК.