• определение генетического варианта ВИЧ-1 на основании анализа нуклеотидных последовательностей генов протеазы, обратной транскриптазы, интегразы и V3 петли белка gp120;
• секвенирование всей кодирующей области генома ВИЧ-1 с помощью массового параллельного секвенирования;
• идентификация микроорганизмов методом времяпролетной MALDI-TOF масс-спектрометрии;
• определение чувствительности к антибиотикам на системе Sensititre;
• полногеномное секвенирование бактериальных патогенов на высокопроизводительном секвенаторе второго поколения (короткие прочтения);
• полногеномное секвенирование бактериальных патогенов на высокопроизводительном секвенаторе третьего поколения (длинные прочтения);
• выделение хромосомной ДНК бактерий и наработка ДНК-фрагментов;
• сборка геномов и выявление генов резистентности;
• цитофлуориметрический анализ;
• сортировка клеток;
• определение количества ДНК-мишени с помощью ddPCR (без / с дополнительной обработки рестриктазой);
• экстракция образцов (Рибо-золь-D);
• экстракция образцов (Рибо-преп);
• обратная транскрипция (РЕВЕРТА-L);
• секвенирование на платформе MiSeq (парные прочтения (PE), длина прочтения 300 п.о., 1 запуск 20 миллионов пар прочтений);
• подготовка библиотек ампликонов 16S;
• пробоподготовка библиотек ДНК вирусов (выделение ДНК включено);
• пробоподготовка РНК вирусов (выделение РНК включено);
• секвенирование фрагментов ДНК (плазмиды, ампликоны);
• документирование агарозных (ДНК) и полиакриламидных (белки) гелей; анализ одномерных и двумерных гелей; анализ вестерн- и дот-блотов; детекция флуоресценции, хемилюминесценции (с проведением электрофореза ДНК);
• документирование агарозных (ДНК) и полиакриламидных (белки) гелей; анализ одномерных и двумерных гелей; анализ вестерн- и дот-блотов; детекция флуоресценции, хемилюминесценции (с проведением электрофореза белков);
• ПЦР в реальном времени с детекцией флуоресценции (с проведением ПЦР в режиме реального времени);
• ПЦР в реальном времени с детекцией флуоресценции (с проведением ПЦР в реальном времени (с экстракцией ДНК из биологического материала));
• ПЦР в реальном времени с детекцией флуоресценции (с проведением ПЦР в реальном времени (с экстракцией РНК из биологического материала и получением кДНК на матрице РНК));
• ПЦР в реальном времени с детекцией флуоресценции (с проведением ОТ-ПЦР в реальном времени с экстракцией РНК из биологического материала);
• фракционирование клеточной суспензии;
• определение генетических полиморфизмов, связанных и/или ассоциированных с заболеваниями или состояниями, диагностика и генетическая предрасположенность к которым имеет прикладное биомедицинское значение;
• биоинформатический анализ данных и подбор олигонуклеотидных праймеров и зондов для цифровой ПЦР;
• синтез праймеров;
• синтез зондов;
• идентификация микроорганизмов на приборе Phoenix M50;
• определение чувствительности к противомикробным препаратам на приборе Phoenix M50;
• разработка методики для количественной оценки бактериальной ДНК.

• культивирование микроорганизмов;
• микробиологические исследования;
• ПЦР-анализ биологических объектов;
• микробиологическое профилирование;
• таргетный анализ;
• сложные генетические анализы.

Лаборатория Молекулярно-генетических и микробиологических методов ФИЦ КазНЦ РАН основана в 2021 году в рамках выполнения Федеральной научно-технической программы развития генетических технологий на 2019–2030 годы. Инфраструктура лаборатории представлена современным исследовательским высокотехнологическим оборудованием (микробиология, молекулярная генетика), фитотронами для культивирования растений и вегетационным домиком, а также своими опытными полевыми площадями. Лаборатория способна решать широкий спектр проектных задач от этапа формировании идей до пилотных испытаний продуктов.

Лаборатория предоставляет следующие услуги на коммерческой основе:

1. Выделение в чистую культуру микроорганизмов из различных проб (кроме строгих анаэробов).
2. Генетическая идентификация микроорганизмов на основе гена 16S рРНК.
3. Проведение высокопроизводительного полногеномного секвенирования, аннотации генома на основе полученных данных, поиск целевых генов.
4. Клонирование генов, подбор условий и оптимизация экспрессии рекомбинантных белков.
5. Подбор условий культивирования микроорганизмов от чашки Петри до ферментера. В распоряжении лаборатории ферментеры малых объемов (до 12 литров, и система 30-300 литров от BIORUS.
6. Маркирование и мониторинг штаммов искусственными уникальными последовательностями, поиск природных уникальных последовательностей. Разработка ПЦР-системы детекции.
7. Таргетный метабаркодинг бактериальных и грибных сообществ.
8. Генетическая инженерия штаммов родов Pseudomonas, Bacillus, Escherichia coli, Corynebacterium glutamicum.
9. Испытания препаратов (химических, биологических) на сельскохозяйственных культурах (в фитокамере, вегетационном домике или мелкоделяночные испытания).
10. Определение КОЕ биопрепаратов и контроль качества.
11. Реверс-инжиниринг зарубежных решений, которые ушли с рынка.

Компания «Клонинг Фасилити» оказывает следующие виды услуг:

• секвенирование плазмид целиком по технологии Nanopore;
• синтез ДНК («синтез гена»);
• наработка плазмид;
• сборка плазмид;
• получение штаммов- продуцентов на основе собственного высокопродуктивного штамма дрожжей Pichia pastoris;
• производство ферментов для биотехнологии;
• научно-исследовательские разработки на заказ.