Биореактивы

Магнитный сорбент ExtraGen® представляет собой водную суспензию твердофазных магнитных частиц на основе оксида железа и оксида кремния. Он предназначен для выделения нуклеиновых кислот из клинических и биологических образцов. Суспензия магнитного сорбента обладает «промежуточной» седиментационной устойчивостью, что особенно важно при использовании материала в автоматических системах выделения ДНК. Частицы ExtraGen® устойчивы к нагреву, сильным окислителям и интенсивным механическим воздей­ствиям (центрифугирование, дисперги­рование и т.п.). Использование фирменного буферного раствора позволяет хранить частицы при комнатной температуре в течение года без ухудшения их сорбционных свойств. Как показали испытания, сорбент ExtraGen® проявляет высокую эффективность при выделении нуклеиновых кислот как в ручном режиме, так и с использованием автоматических станций.

В основе работы набора лежит мультиплексная амплификация 28-ми STR-локусов с последующим разделением ПЦР-продуктов методом капиллярного электрофореза. Из них 25 аутосомных локуса: D3S1358, D2S441, D1S1656, D19S433, TPOX, D2S1338, TH01, D16S539, CSF1PO, D18S51, D21S11, D22S1045, D8S1179, VWA, D5S818, FGA, D13S317, D7S820, D12S391, D10S1248, SE33, DYS391, D8S1132, D7S1517, Penta D, Penta E и 3 половых локуса: Amelоgenin, Yindel, DYS391. Представленные в наборе STR-локусы высоко полиморфны, что позволяет достоверно идентифицировать личность. В набор входят все локусы баз данных CODIS (Combined DNA Index System) и ESS (European Standard Set), а также локусы SE33, Penta D, Penta E. Для получения полного (по всем 28-ти STR-локусам) генотипа исследуемого образца достаточно 0,125 нанограмм (нг) не деградированной ДНК. Оптимальное количество ДНК, вносимой в реакцию, составляет 1 нг. Диапазон концентраций ДНК для проведения амплификации составляет от 0,1 до 4 нг в реакцию.

 Преимущества набора: • ДНК из любых реакционных смесей, фрагменты длины от 70 до 20000 п. о. • Показатели А260/280 = 1,80±0,05, А260/230 ≥ 2,0 • Выделенный ПЦР-продукт пригоден для проведения лигирования, рестрикции, трансформации, секвенирования, ПЦР.

Прин­цип действия на­бо­ра ре­а­ген­тов ALSENSE для выяв­ле­ния Phytoplasma sp. ме­то­дом ПЦР-РВ за­клю­ча­ет­ся в про­ве­де­нии по­ли­ме­раз­ной цеп­ной ре­ак­ции в ре­жи­ме ре­аль­но­го вре­ме­ни (ПЦР-РВ). В ос­но­ве ме­то­да ПЦР ле­жит мно­го­крат­ное удво­е­ние опре­делён­но­го участ­ка ДНК при по­мо­щи ДНК-по­ли­ме­ра­зы в ис­кус­ствен­ных усло­ви­ях (in vitro). В ре­зульта­те на­ра­ба­ты­ва­ют­ся ко­пии ДНК в до­ста­точ­ном для до­сто­вер­но­го опре­де­ле­ния ре­зульта­та ко­ли­че­стве. В хо­де ре­ак­ции ко­пи­ру­ет­ся только за­дан­ный уча­сток ДНК, удо­вле­тво­ря­ю­щий усло­ви­ям спе­ци­фич­но­сти, за­ло­жен­ным в струк­ту­ре прай­ме­ров, и только в том слу­чае, ес­ли он при­сут­ству­ет в ис­сле­ду­е­мом об­раз­це.

На­бор раз­ра­бо­тан на ос­но­ве ре­ко­мен­да­ций Ев­ро­пейской и Сре­ди­зем­но­мор­ской ор­га­ни­за­ции по ка­ран­ти­ну и за­щи­те рас­те­ний (EPPO) и поз­во­ля­ет де­тек­ти­ро­вать ДНК па­то­ге­на ме­то­дом по­ли­ме­раз­ной цеп­ной ре­ак­ции в ре­жи­ме ре­аль­но­го вре­ме­ни. Ми­ше­нью для ам­пли­фи­ка­ции яв­ля­ет­ся уча­сток ams-опе­ро­на Erwinia amylovora. Внут­рен­ний кон­троль (ВКО) раз­ра­бо­тан на ос­но­ве по­сле­до­ва­тель­но­стей ге­нов 18S-ри­бо­сом­ной РНК яб­ло­ни и гру­ши. Зонд TaqMan® к участ­ку ге­но­ма Erwinia amylovora не­сет на 5’-кон­це мет­ку-кра­си­тель FAM. ВКО-спе­ци­фич­ный зонд ме­чен флу­о­ро­фо­ром HEX, что поз­во­ля­ет поль­зо­ва­те­лю ва­ли­ди­ро­вать этап экс­трак­ции ДНК из рас­те­ний.

Фьюжн ДНК-полимераза является рекомбинантным полипептидом, состоящим из слитых термостабильной ДНК-полимеразы Pyrococcus furiosus (Pfu) и ДНК- связывающего белка термофильных архей вида Sulfolobus solfataricus (Sso7d). Белок Sso7d связывается с малой бороздкой двухцепочечной ДНК и дополнительно стабилизирует комплекс полимеразы с матрицей. Благодаря этому Фьюжн ДНК-полимераза, обладает повышенной процессивностью, точностью синтеза, скоростью амплификации фрагментов и повышенной устойчивостью к ингибиторам ПЦР по сравнению с нативной Pfu ДНК- полимеразой [1]. Фьюжн ДНК-полимераза обладает 5’→3’ полимеразной активностью, 3’→5’ экзонуклеазной активностью и синтезирует продукты с тупыми концами. Фьюжн ДНК-полимераза является хорошим выбором для рутинного клонирования и может использоваться для получения методом ПЦР длинных или сложных ампликонов. Примеры использования Фьюжн ДНК-полимеразы представлены в конце описания. Фьюжн ДНК-полимераза выделена из штамма E.coli, содержащего плазмиду с клонированным фрагментом ДНК, состоящим из слитых генов термостабильной ДНК-полимеразы Pyrococcus furiosus (Pfu) и ДНК-связывающего белка Sulfolobus solfataricus (Sso7d). Одна единица активности соответствует количеству фермента, необходимому для включения 10 нмолей dNTP в кислотонерастворимую фракцию ДНК за 30 мин при 74°С.

Набор «Система для количественной оценки примесей «хозяйской» ДНК E. coli методом ПЦР-РВ» удобен и прост в использовании, позволяет выделить остаточную ДНК из образца и провести её амплификацию с использованием ПЦР в режиме реального времени в присутствии флуоресцентного красителя SYBR Green I. В состав набора входят реагенты для выделения ДНК из нуклеопротеиновых комплексов и удаления ингибиторов ПЦР, 2× реакционная смесь БиоМастер HS-qPCR SYBR Blue (2×), стандартный раствор ДНК и проверенный набор специфичных праймеров к консервативному району 16S рРНК E.coli.

Genta-RT kit представляет собой набор реагентов для проведения синтеза первой цепи кДНК на матрице РНК. Набор включает в себя: in silico модифицированный гомолог обратной транскриптазы вируса лейкемии мышей Молони (MMLV) – Genta REV M ревертазу; Олиго(dT)18 праймер; воду для ПЦР и 2 вида 5-кратного реакционного буфера (включающего в себя дНТФ и ДТТ): 5х ОТ-буфер R – наличие Random-праймеров в реакционном буфере позволяет проводить синтез тотальной кДНК. 5х ОТ-буфер – требуется добавление специфических праймеров для синтеза целевого фрагмента кДНК; или добавление Олиго(dT)18 праймера для полиаденилированной РНК.

Для разных видов ПЦР Для приготовления буферных растворов Для приготовления реакционной смеси Внутренний лабораторный контроль качества Вода для ПЦР хранится в упаковке изготовителя при температуре -20 °С Срок годности - 12 месяцев с даты изготовления Оперативная доставка

Ревертаза с «теплым стартом» Повышенная эффективность при работе с GC-богатыми РНК-матрицами ДНК-полимераза с «горячим стартом» Высокая специфичность и чувствительность реакции Высокий выход ПЦР-продукта Для ПЦР-РВ с интеркалирующими красителями Внутренний лабораторный контроль качества ArtMix-RT Color ревертаза хранится в упаковке изготовителя при температуре от -24 °С до -16 °С Допускается хранение от +2 до +8 °С в течение 360 дней с момента производства при условии, что реагент подвергался заморозке/оттаиванию не более 1 раза Срок годности - 24 месяца с даты изготовления Оперативная доставка

Возможность варьирования состава реакционной смеси Для разных видов ПЦР Внутренний лабораторный контроль качества Буфер для ПЦР хранится в упаковке изготовителя при температуре от -20 °С Срок годности - 12 месяцев с даты изготовления Оперативная доставка

5-кратный реакционный буфер, не содержащий сульфат магния.